More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  100 
 
 
521 aa  1064    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  98.66 
 
 
521 aa  1049    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  59.12 
 
 
551 aa  601  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  49.13 
 
 
508 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  47.78 
 
 
498 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  49.38 
 
 
513 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  47.93 
 
 
536 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  47.5 
 
 
489 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  44.17 
 
 
506 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  43.56 
 
 
521 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  44.51 
 
 
518 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  44.32 
 
 
518 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  40.85 
 
 
504 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  39.38 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  37.59 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  36.29 
 
 
477 aa  276  9e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  30.77 
 
 
554 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  30.77 
 
 
554 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  29.69 
 
 
551 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  29.26 
 
 
546 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  30.78 
 
 
551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  30.78 
 
 
551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  31.87 
 
 
556 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  29.94 
 
 
546 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  30 
 
 
561 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  30.78 
 
 
544 aa  210  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  29.72 
 
 
568 aa  209  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  30.6 
 
 
549 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.72 
 
 
568 aa  206  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  29.03 
 
 
568 aa  200  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  30.63 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  33.9 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  30.18 
 
 
513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  33.26 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  31.49 
 
 
504 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  28.89 
 
 
803 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.26 
 
 
527 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  27.7 
 
 
705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  32.65 
 
 
502 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  33.04 
 
 
483 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.16 
 
 
565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  28.07 
 
 
580 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  28.99 
 
 
569 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  31.79 
 
 
589 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  30.92 
 
 
434 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  30.92 
 
 
434 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  33.6 
 
 
604 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  28.46 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.32 
 
 
592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  33.15 
 
 
574 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  35.33 
 
 
566 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  31.88 
 
 
606 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  32.97 
 
 
619 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  33.51 
 
 
621 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  33.33 
 
 
621 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  34.11 
 
 
606 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  31.72 
 
 
652 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  31.72 
 
 
671 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  34.98 
 
 
601 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  31.72 
 
 
652 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  34.98 
 
 
601 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  31.61 
 
 
640 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  27.12 
 
 
561 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  29.79 
 
 
1064 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  31.34 
 
 
516 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  31.22 
 
 
572 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  31.64 
 
 
605 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  31.81 
 
 
669 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  30.85 
 
 
605 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  33.22 
 
 
607 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31.19 
 
 
656 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  30.38 
 
 
604 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  28.28 
 
 
576 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  33.16 
 
 
673 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  34.9 
 
 
626 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  29.57 
 
 
464 aa  153  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  29.57 
 
 
464 aa  153  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  35.79 
 
 
637 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  31.5 
 
 
630 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  30.95 
 
 
598 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  32.4 
 
 
627 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  33.33 
 
 
594 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  26.11 
 
 
624 aa  149  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  32.98 
 
 
605 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  31.48 
 
 
633 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  33.23 
 
 
579 aa  147  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  33.87 
 
 
606 aa  146  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  33.76 
 
 
606 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  31.83 
 
 
590 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  32.88 
 
 
612 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  28.86 
 
 
664 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  30.61 
 
 
593 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  34.03 
 
 
605 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  29.38 
 
 
664 aa  144  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  29.11 
 
 
666 aa  144  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  31.58 
 
 
602 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  31.56 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  32.67 
 
 
581 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  32.87 
 
 
631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>