More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3078 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 871 aa  1822    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  58.82 
 
 		 705 aa  877    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  73.99 
 
 		 746 aa  1144    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  35.1 
 
 		 809 aa  439  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  35.95 
 
 		 579 aa  317  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  35.84 
 
 		 563 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  34.4 
 
 		 594 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  36.4 
 
 		 572 aa  303  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  34.84 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  36.79 
 
 		 568 aa  298  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  36.25 
 
 		 568 aa  298  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  34.26 
 
 		 601 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  33.33 
 
 		 584 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  35.48 
 
 		 605 aa  294  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  39.04 
 
 		 946 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  35.52 
 
 		 568 aa  290  8e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  34.86 
 
 		 605 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  35.73 
 
 		 592 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  34.86 
 
 		 593 aa  289  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  34.71 
 
 		 590 aa  288  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  34.55 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  33.97 
 
 		 621 aa  286  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  34.5 
 
 		 594 aa  285  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  34.36 
 
 		 606 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  34.47 
 
 		 589 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  34.49 
 
 		 607 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  35.45 
 
 		 604 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.44 
 
 		 606 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  34.56 
 
 		 561 aa  283  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  33.51 
 
 		 598 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  33.57 
 
 		 614 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  32.88 
 
 		 659 aa  281  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  33.74 
 
 		 581 aa  281  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  33.98 
 
 		 637 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  34.15 
 
 		 599 aa  279  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  34.18 
 
 		 803 aa  278  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  33.7 
 
 		 574 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  33.45 
 
 		 566 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  32.77 
 
 		 630 aa  278  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  33 
 
 		 642 aa  277  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  33.06 
 
 		 638 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  32.39 
 
 		 633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  32.06 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.95 
 
 		 664 aa  275  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  32.74 
 
 		 604 aa  275  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  33.45 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  33.68 
 
 		 619 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  32 
 
 		 621 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  33.16 
 
 		 611 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  32.52 
 
 		 657 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  33.93 
 
 		 569 aa  273  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  32.64 
 
 		 627 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  33.15 
 
 		 561 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  31.23 
 
 		 626 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  32.86 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  41.27 
 
 		 941 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  31.96 
 
 		 664 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  32.73 
 
 		 556 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  30.46 
 
 		 656 aa  268  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  33.16 
 
 		 604 aa  265  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  30.93 
 
 		 612 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  30.85 
 
 		 631 aa  260  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  30.85 
 
 		 631 aa  260  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  32.76 
 
 		 606 aa  258  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  33.04 
 
 		 606 aa  257  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  32.38 
 
 		 602 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  32.01 
 
 		 600 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  31.61 
 
 		 564 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  37.58 
 
 		 671 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  37.58 
 
 		 652 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  37.58 
 
 		 652 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  33.41 
 
 		 666 aa  211  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  39.13 
 
 		 669 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  37.73 
 
 		 672 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  36.36 
 
 		 680 aa  204  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1064 aa  197  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  26.7 
 
 		 511 aa  193  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  35.35 
 
 		 640 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  30.93 
 
 		 673 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  25.14 
 
 		 551 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.03 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  27.44 
 
 		 489 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  27.12 
 
 		 498 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.46 
 
 		 506 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  25.7 
 
 		 477 aa  127  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  27.96 
 
 		 521 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  28.18 
 
 		 483 aa  125  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  28.16 
 
 		 521 aa  124  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.34 
 
 		 478 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  27.1 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  27.59 
 
 		 521 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  28.35 
 
 		 504 aa  121  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  29.37 
 
 		 565 aa  121  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05397  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  24.69 
 
 		 664 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.436415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  26.92 
 
 		 518 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  26.92 
 
 		 518 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  23.35 
 
 		 464 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  23.35 
 
 		 464 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  27.4 
 
 		 513 aa  114  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  28.36 
 
 		 576 aa  112  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>