More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4840 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 497 aa  1001    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  62.6 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  64.88 
 
 		 483 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  52.07 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  48.56 
 
 		 502 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  43.36 
 
 		 516 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  35.48 
 
 		 513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  35.9 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  31.76 
 
 		 498 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  33.97 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  33.9 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  32.08 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  31.39 
 
 		 521 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  31.79 
 
 		 489 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  33.99 
 
 		 536 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  33.26 
 
 		 551 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  34.27 
 
 		 513 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  31.08 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.81 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  30.95 
 
 		 518 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  30.95 
 
 		 518 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  29.18 
 
 		 705 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  28.97 
 
 		 544 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.75 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  28.75 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.96 
 
 		 511 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  28.82 
 
 		 563 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  29.68 
 
 		 546 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31.49 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.86 
 
 		 546 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.6 
 
 		 568 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  30.48 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  29.49 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  27.34 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  28.55 
 
 		 568 aa  167  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  27.55 
 
 		 551 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  27.55 
 
 		 551 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  27.23 
 
 		 549 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  28.17 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  27.54 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.34 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  26.49 
 
 		 561 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.74 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  28.47 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  37.13 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  27.33 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  27.55 
 
 		 576 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  28.8 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  28.6 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  29.39 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  28.73 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  27.36 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  27.25 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  29.05 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1064 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  29.85 
 
 		 579 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  27.13 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  25.32 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  29.51 
 
 		 621 aa  123  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  25.89 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  29.62 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  26.32 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  29.64 
 
 		 590 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  30.21 
 
 		 673 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  25.27 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  25.93 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  25.98 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  25.16 
 
 		 459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  27.43 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  29.14 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  26.34 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  30.82 
 
 		 599 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  31.01 
 
 		 604 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  25.91 
 
 		 638 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  28.91 
 
 		 611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  42.86 
 
 		 809 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  29.47 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  27.22 
 
 		 656 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  43.51 
 
 		 946 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  27.19 
 
 		 941 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  30.17 
 
 		 630 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  24.54 
 
 		 871 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  27.83 
 
 		 640 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  28.14 
 
 		 664 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  29.29 
 
 		 602 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  28.44 
 
 		 626 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  30.07 
 
 		 605 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  29.29 
 
 		 605 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  27.47 
 
 		 604 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  26.8 
 
 		 746 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  25.55 
 
 		 601 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  25.16 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  27.52 
 
 		 594 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  27.68 
 
 		 633 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  25 
 
 		 601 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  28.53 
 
 		 621 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.05 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  25.98 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  25.98 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>