More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4490 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  100 
 
 
551 aa  1122    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  60 
 
 
521 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  59.31 
 
 
521 aa  617  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  49.71 
 
 
498 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  47.13 
 
 
508 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  47.7 
 
 
513 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  44.65 
 
 
536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  44.4 
 
 
521 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  43.85 
 
 
518 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  44.78 
 
 
489 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  43.85 
 
 
518 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  43.96 
 
 
506 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  41.84 
 
 
504 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  39.78 
 
 
511 aa  331  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  32.45 
 
 
554 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  32.45 
 
 
554 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  30.91 
 
 
544 aa  228  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  32.42 
 
 
546 aa  226  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  31.78 
 
 
546 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  30.8 
 
 
551 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  32.99 
 
 
527 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  30.2 
 
 
549 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  30.02 
 
 
551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  30.02 
 
 
551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.65 
 
 
568 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  35.57 
 
 
483 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  28.47 
 
 
568 aa  211  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  30.22 
 
 
561 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.54 
 
 
565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  27.74 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  33.83 
 
 
497 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 
499 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  28.32 
 
 
561 aa  192  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  27.83 
 
 
803 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  33.03 
 
 
504 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  29.13 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  34.11 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  27.24 
 
 
705 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  29.09 
 
 
563 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  30.72 
 
 
515 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  28.32 
 
 
556 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  28.04 
 
 
572 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  30.75 
 
 
434 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  30.75 
 
 
434 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  32.59 
 
 
516 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  29.58 
 
 
456 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  31.22 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  31.22 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  28.35 
 
 
476 aa  163  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  30.21 
 
 
576 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  27.25 
 
 
460 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  31.75 
 
 
566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  33.87 
 
 
594 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  29.87 
 
 
664 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  30.13 
 
 
666 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  30.69 
 
 
630 aa  151  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  31.36 
 
 
574 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  30.91 
 
 
627 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  30.69 
 
 
633 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  32.13 
 
 
580 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  29.71 
 
 
589 aa  150  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  28.07 
 
 
601 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  31.5 
 
 
592 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  33.66 
 
 
664 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  28.54 
 
 
601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  31.19 
 
 
604 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  29.57 
 
 
1064 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  27.63 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  30.73 
 
 
657 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  32.71 
 
 
605 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  30.73 
 
 
605 aa  147  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  31.38 
 
 
604 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  28.02 
 
 
456 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  31.49 
 
 
640 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  31.69 
 
 
669 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  29.82 
 
 
621 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  30.25 
 
 
642 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  32.17 
 
 
607 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  32.37 
 
 
671 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  26.14 
 
 
535 aa  145  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  30.71 
 
 
656 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  32.37 
 
 
652 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  29.7 
 
 
673 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  32.37 
 
 
652 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  32.18 
 
 
619 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  34.24 
 
 
626 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  30.4 
 
 
672 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  27.63 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  32.92 
 
 
579 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  33.22 
 
 
621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  27.66 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  26.56 
 
 
463 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  34.16 
 
 
584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  30.7 
 
 
606 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  27.89 
 
 
457 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  30.75 
 
 
606 aa  140  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.62 
 
 
437 aa  140  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  32.81 
 
 
606 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  30.59 
 
 
598 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>