More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1828 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  59.97 
 
 		 671 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  68.18 
 
 		 621 aa  846    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  60.47 
 
 		 606 aa  694    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  100 
 
 		 566 aa  1165    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  94.77 
 
 		 574 aa  1114    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  61.14 
 
 		 669 aa  825    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  59.97 
 
 		 652 aa  769    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  69.4 
 
 		 589 aa  830    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  69.37 
 
 		 604 aa  865    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  67.44 
 
 		 606 aa  822    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  69.05 
 
 		 592 aa  803    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  58.88 
 
 		 600 aa  679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  71.06 
 
 		 572 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  60.64 
 
 		 606 aa  697    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  70.36 
 
 		 607 aa  839    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  64.52 
 
 		 605 aa  791    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  60 
 
 		 602 aa  685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  66.88 
 
 		 619 aa  848    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  59.97 
 
 		 652 aa  769    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  71.07 
 
 		 606 aa  841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  70.52 
 
 		 580 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  56.22 
 
 		 594 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  68.26 
 
 		 605 aa  860    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  54.07 
 
 		 626 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  55.11 
 
 		 561 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  50.16 
 
 		 656 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  51.67 
 
 		 642 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  50.55 
 
 		 657 aa  611  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  51.69 
 
 		 631 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  52.35 
 
 		 630 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  52.26 
 
 		 604 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  50.39 
 
 		 664 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  53.14 
 
 		 614 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  51.69 
 
 		 631 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  56.59 
 
 		 579 aa  605  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  49.54 
 
 		 672 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  52.1 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  53.64 
 
 		 598 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  51.41 
 
 		 612 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  52.03 
 
 		 627 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  54.71 
 
 		 564 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  52.68 
 
 		 605 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  55.46 
 
 		 605 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  51.88 
 
 		 581 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  46.78 
 
 		 664 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  52.08 
 
 		 659 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  48.86 
 
 		 621 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  48.05 
 
 		 638 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  46.12 
 
 		 601 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  45.92 
 
 		 601 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  47.55 
 
 		 637 aa  544  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  50 
 
 		 568 aa  536  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  48.57 
 
 		 630 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  48.72 
 
 		 604 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  50 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  49.81 
 
 		 568 aa  531  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  46.77 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  49.25 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  47.63 
 
 		 593 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  48.24 
 
 		 569 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  46.33 
 
 		 584 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  47.81 
 
 		 590 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  46.47 
 
 		 594 aa  488  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  46.17 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  46.37 
 
 		 611 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  46.61 
 
 		 599 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  54.99 
 
 		 640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  50.24 
 
 		 666 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  46.8 
 
 		 673 aa  353  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  50.15 
 
 		 680 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  33.96 
 
 		 809 aa  319  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  34.81 
 
 		 803 aa  318  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  34.69 
 
 		 746 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  35.16 
 
 		 705 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  32.91 
 
 		 871 aa  273  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  40.38 
 
 		 946 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1064 aa  250  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  37.78 
 
 		 941 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.98 
 
 		 511 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  30.81 
 
 		 536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.32 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.1 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.65 
 
 		 546 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.37 
 
 		 554 aa  177  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.37 
 
 		 554 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.71 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  35.33 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  33.24 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  35 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  32.44 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  32.24 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  33.44 
 
 		 506 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  31.95 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  31.07 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  31.95 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  32.93 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  32.25 
 
 		 565 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  33.24 
 
 		 478 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  24.25 
 
 		 549 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  24.53 
 
 		 544 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>