More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1324 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  66.39 
 
 		 612 aa  796    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  55.43 
 
 		 619 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  58.26 
 
 		 580 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  66.67 
 
 		 605 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  56.93 
 
 		 604 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  58.13 
 
 		 607 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  55.52 
 
 		 589 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  59.54 
 
 		 581 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  54.08 
 
 		 606 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  55.69 
 
 		 568 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  69.68 
 
 		 598 aa  811    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  100 
 
 		 561 aa  1155    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  56.67 
 
 		 605 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  58.63 
 
 		 572 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  64.25 
 
 		 594 aa  776    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  67.79 
 
 		 604 aa  819    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  56.18 
 
 		 568 aa  643    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  65.84 
 
 		 614 aa  814    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  67.55 
 
 		 605 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  59.09 
 
 		 564 aa  659    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  56.83 
 
 		 605 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  58.94 
 
 		 606 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  58.36 
 
 		 592 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  55.4 
 
 		 568 aa  633  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  55.11 
 
 		 566 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  53.71 
 
 		 574 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  51.66 
 
 		 606 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  52.78 
 
 		 602 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  51.66 
 
 		 606 aa  601  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  52.89 
 
 		 600 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  54.61 
 
 		 579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  72.01 
 
 		 640 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  70.34 
 
 		 627 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  69.47 
 
 		 626 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  47.02 
 
 		 601 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  46.85 
 
 		 601 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  48.98 
 
 		 637 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  71.75 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  71.75 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  69.59 
 
 		 630 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  69.09 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  49.03 
 
 		 604 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  48.83 
 
 		 584 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  49.52 
 
 		 556 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  49.17 
 
 		 569 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  49.71 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  65.59 
 
 		 621 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  50.1 
 
 		 563 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  47.4 
 
 		 590 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  44.83 
 
 		 611 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  63.76 
 
 		 671 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  62.63 
 
 		 669 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  63.76 
 
 		 652 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  63.76 
 
 		 652 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  44.83 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  47.96 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  45.2 
 
 		 594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  57 
 
 		 656 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  54.93 
 
 		 664 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  54.66 
 
 		 664 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  54.5 
 
 		 666 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  56.65 
 
 		 657 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  58.24 
 
 		 659 aa  422  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  57.69 
 
 		 642 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  57.42 
 
 		 672 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  58.47 
 
 		 621 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  56.25 
 
 		 638 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  54.42 
 
 		 630 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  48.52 
 
 		 673 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  51.87 
 
 		 680 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  36.86 
 
 		 803 aa  330  5.0000000000000004e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  35.66 
 
 		 705 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  33.76 
 
 		 871 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  34.81 
 
 		 746 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  42.62 
 
 		 1064 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  39.76 
 
 		 946 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  39.47 
 
 		 941 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.88 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  31.15 
 
 		 518 aa  223  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  31.15 
 
 		 518 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  39.26 
 
 		 809 aa  219  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  30.95 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  31.7 
 
 		 504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  30.57 
 
 		 521 aa  216  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  30.57 
 
 		 521 aa  211  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  31.52 
 
 		 536 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  31.76 
 
 		 513 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.12 
 
 		 478 aa  203  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  29.9 
 
 		 551 aa  203  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  30.69 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  29.37 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.98 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.92 
 
 		 527 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.89 
 
 		 546 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.5 
 
 		 554 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.5 
 
 		 554 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.59 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.59 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.15 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.35 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>