More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5100 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  56.48 
 
 		 652 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  52.46 
 
 		 656 aa  668    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  74 
 
 		 630 aa  936    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  55.34 
 
 		 669 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  73.91 
 
 		 605 aa  944    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  53.53 
 
 		 589 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  83.6 
 
 		 612 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  53.12 
 
 		 580 aa  656    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  54.08 
 
 		 606 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  75.78 
 
 		 598 aa  974    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  81.25 
 
 		 631 aa  1018    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  52.48 
 
 		 605 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  54.09 
 
 		 621 aa  666    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  54.79 
 
 		 604 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  62.69 
 
 		 627 aa  816    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  64.15 
 
 		 581 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  75.31 
 
 		 614 aa  973    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  74.92 
 
 		 605 aa  941    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  56.48 
 
 		 652 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  76.19 
 
 		 626 aa  963    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  55.54 
 
 		 619 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  81.25 
 
 		 631 aa  1018    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  56.48 
 
 		 671 aa  701    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  100 
 
 		 640 aa  1310    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  73.84 
 
 		 633 aa  934    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  60.53 
 
 		 594 aa  782    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  55.78 
 
 		 605 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  87.34 
 
 		 604 aa  1125    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  53.76 
 
 		 592 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  51.24 
 
 		 657 aa  626  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  50.08 
 
 		 664 aa  624  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  55.03 
 
 		 607 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  49.92 
 
 		 672 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  54.82 
 
 		 606 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  51.27 
 
 		 642 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  50.55 
 
 		 659 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  50.24 
 
 		 566 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  49.45 
 
 		 606 aa  610  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  49.45 
 
 		 606 aa  609  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  49.45 
 
 		 574 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  52.12 
 
 		 572 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  47.23 
 
 		 664 aa  600  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  49.68 
 
 		 602 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  46.72 
 
 		 666 aa  589  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  49.69 
 
 		 600 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  51.62 
 
 		 579 aa  581  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  47.3 
 
 		 638 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  72.27 
 
 		 561 aa  561  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  46.95 
 
 		 621 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  44.9 
 
 		 601 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  44.75 
 
 		 601 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  47.31 
 
 		 604 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  45.95 
 
 		 637 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  43.01 
 
 		 673 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  45.88 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  44.7 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  42.59 
 
 		 584 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  42.9 
 
 		 593 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  41.03 
 
 		 680 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  42.25 
 
 		 556 aa  455  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  41.97 
 
 		 630 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  42.36 
 
 		 590 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  57.33 
 
 		 564 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  42.03 
 
 		 599 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  41.37 
 
 		 563 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  53.33 
 
 		 568 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  52.56 
 
 		 568 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  52.56 
 
 		 568 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  39.12 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  52 
 
 		 561 aa  353  7e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  32.61 
 
 		 809 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  38.42 
 
 		 1064 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  30.95 
 
 		 746 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  40.19 
 
 		 803 aa  243  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  35.94 
 
 		 946 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  34.78 
 
 		 941 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  36.11 
 
 		 705 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  35.47 
 
 		 871 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  32.36 
 
 		 521 aa  157  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  31.88 
 
 		 521 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  33.22 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  31.2 
 
 		 551 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  32.84 
 
 		 477 aa  144  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  33.65 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  33.65 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.62 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  31.87 
 
 		 504 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  33.56 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  32.76 
 
 		 513 aa  138  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  31.75 
 
 		 518 aa  137  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  31.75 
 
 		 518 aa  137  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  30.31 
 
 		 546 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  32.82 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  35.11 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  32.99 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  29.23 
 
 		 546 aa  135  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.49 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32 
 
 		 511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  29.56 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  29.56 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>