More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0310 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 
489 aa  967    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  65.45 
 
 
536 aa  609  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  63.51 
 
 
508 aa  588  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  50.91 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  52.22 
 
 
513 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  49.17 
 
 
521 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  49.17 
 
 
521 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  51.15 
 
 
521 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  52.26 
 
 
506 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  50 
 
 
518 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  50 
 
 
518 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  46.68 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  46.59 
 
 
504 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  46.42 
 
 
511 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  40.59 
 
 
478 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  38.89 
 
 
477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  32.09 
 
 
554 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  32.09 
 
 
554 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  31.2 
 
 
551 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  31.13 
 
 
546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  30.48 
 
 
544 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  32.02 
 
 
551 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  32.02 
 
 
551 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  31.94 
 
 
549 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  32.26 
 
 
546 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  30.25 
 
 
527 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  28.47 
 
 
568 aa  224  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  31.68 
 
 
515 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  27.47 
 
 
568 aa  220  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  30.73 
 
 
513 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  29.2 
 
 
565 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.19 
 
 
568 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  33.69 
 
 
483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  33.76 
 
 
502 aa  213  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  33.26 
 
 
504 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  28.98 
 
 
803 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  33.12 
 
 
497 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  28.99 
 
 
705 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  31.68 
 
 
499 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  33.33 
 
 
563 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  31.08 
 
 
576 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31.81 
 
 
476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  41.29 
 
 
545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  32.18 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  34.59 
 
 
601 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  33.96 
 
 
601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  31.07 
 
 
464 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  31.07 
 
 
464 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  27.8 
 
 
561 aa  170  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  33.7 
 
 
566 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  37.42 
 
 
621 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  33.43 
 
 
574 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  33.42 
 
 
561 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  30.61 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  29.72 
 
 
456 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  35.29 
 
 
590 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  29.84 
 
 
463 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  33.44 
 
 
656 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  35.06 
 
 
607 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  35.71 
 
 
580 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  29.83 
 
 
459 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  29.76 
 
 
463 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 
460 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  37.07 
 
 
594 aa  159  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  29.25 
 
 
468 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  29.28 
 
 
457 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.65 
 
 
664 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  35.39 
 
 
606 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  30.32 
 
 
516 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  35.84 
 
 
604 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  30.3 
 
 
461 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  34.21 
 
 
621 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  27.65 
 
 
437 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  33.68 
 
 
592 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  33.79 
 
 
638 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.66 
 
 
592 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  29.57 
 
 
463 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  33.23 
 
 
809 aa  156  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 
457 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  36.14 
 
 
584 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  35.48 
 
 
593 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  29.84 
 
 
463 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  33.9 
 
 
589 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  36.46 
 
 
556 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  35.37 
 
 
611 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  31.39 
 
 
664 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  36.3 
 
 
619 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  35.31 
 
 
572 aa  153  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  35.47 
 
 
605 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  31.27 
 
 
666 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  34.8 
 
 
652 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  34.8 
 
 
652 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  34.8 
 
 
671 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  32.87 
 
 
594 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  30.55 
 
 
746 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  35.15 
 
 
669 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  29.12 
 
 
672 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  29.41 
 
 
642 aa  150  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  34.88 
 
 
604 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  25.96 
 
 
570 aa  150  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>