More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3810 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  69.79 
 
 		 652 aa  918    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  73.29 
 
 		 566 aa  861    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  70.53 
 
 		 621 aa  887    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  74.88 
 
 		 607 aa  890    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  72.44 
 
 		 574 aa  854    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  69.79 
 
 		 671 aa  918    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  77.76 
 
 		 589 aa  965    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  52.27 
 
 		 630 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  76.38 
 
 		 580 aa  931    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  55.38 
 
 		 594 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  74.75 
 
 		 606 aa  936    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  77.7 
 
 		 592 aa  944    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  55.95 
 
 		 598 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  57.74 
 
 		 561 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  71.48 
 
 		 605 aa  880    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  100 
 
 		 572 aa  1178    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  75.17 
 
 		 604 aa  941    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  60.84 
 
 		 606 aa  727    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  60.7 
 
 		 606 aa  731    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  74.88 
 
 		 605 aa  942    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  55.32 
 
 		 614 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  57.42 
 
 		 605 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  61.93 
 
 		 600 aa  724    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  62.24 
 
 		 602 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  72.59 
 
 		 619 aa  924    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  69.79 
 
 		 652 aa  918    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  76.29 
 
 		 606 aa  907    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  54.29 
 
 		 626 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  53.39 
 
 		 604 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  51.36 
 
 		 633 aa  632  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  53.17 
 
 		 631 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  75.7 
 
 		 669 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  53.41 
 
 		 612 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  53.17 
 
 		 631 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  59.56 
 
 		 579 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  52.58 
 
 		 605 aa  621  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  53.55 
 
 		 627 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  50.55 
 
 		 664 aa  618  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  50.8 
 
 		 642 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  52.69 
 
 		 659 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  50 
 
 		 657 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  53.09 
 
 		 581 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  49.09 
 
 		 672 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  47.63 
 
 		 666 aa  593  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  52.12 
 
 		 621 aa  589  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  53 
 
 		 564 aa  590  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  46.96 
 
 		 638 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  47.72 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  47.23 
 
 		 601 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  46.7 
 
 		 664 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  50.16 
 
 		 637 aa  575  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  49.92 
 
 		 630 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  51.05 
 
 		 604 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  49.11 
 
 		 590 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  49.07 
 
 		 568 aa  531  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  49.06 
 
 		 568 aa  534  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  48.88 
 
 		 568 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  48.11 
 
 		 584 aa  528  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  48.06 
 
 		 561 aa  522  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  47.53 
 
 		 593 aa  525  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  48.25 
 
 		 563 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  48.21 
 
 		 611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  49.43 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  49.34 
 
 		 556 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  48.36 
 
 		 594 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  47 
 
 		 599 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  58.19 
 
 		 656 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  47.63 
 
 		 673 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  51.83 
 
 		 680 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  34.54 
 
 		 803 aa  317  5e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  34.47 
 
 		 809 aa  313  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  35.11 
 
 		 746 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  36.81 
 
 		 871 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  34.14 
 
 		 705 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  43.42 
 
 		 946 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1064 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  41.38 
 
 		 941 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  48.99 
 
 		 640 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  30.2 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  28.04 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  35.39 
 
 		 504 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  32.7 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  32.33 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  32.92 
 
 		 521 aa  157  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  27.84 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  34.53 
 
 		 506 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  28.03 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  32.92 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.54 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  36.86 
 
 		 478 aa  146  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  32.52 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  33.22 
 
 		 536 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  25.87 
 
 		 624 aa  140  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.85 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  24.19 
 
 		 515 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  33.46 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  32.72 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  32.35 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  33.08 
 
 		 544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>