More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2296 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  100 
 
 		 705 aa  1477    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  58.82 
 
 		 871 aa  885    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  58.21 
 
 		 746 aa  867    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  43.43 
 
 		 946 aa  314  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  36.19 
 
 		 579 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  34.83 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  35.36 
 
 		 566 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  47.06 
 
 		 941 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  35.29 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.92 
 
 		 592 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.34 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  37.7 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  36.09 
 
 		 568 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  34.91 
 
 		 572 aa  296  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  34.26 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  34.46 
 
 		 605 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  35.7 
 
 		 568 aa  292  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  36.29 
 
 		 568 aa  292  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  44.44 
 
 		 809 aa  289  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  35.77 
 
 		 561 aa  288  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  35.6 
 
 		 561 aa  287  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  34.5 
 
 		 594 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  34.26 
 
 		 580 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  34.58 
 
 		 599 aa  280  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  34.42 
 
 		 606 aa  280  8e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  34.15 
 
 		 584 aa  280  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  33.69 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  33.45 
 
 		 606 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  34.98 
 
 		 556 aa  278  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  33.94 
 
 		 604 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  33.64 
 
 		 606 aa  276  9e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  33.71 
 
 		 590 aa  276  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  33.51 
 
 		 607 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  33.39 
 
 		 604 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  32.97 
 
 		 803 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  33.04 
 
 		 569 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  32.67 
 
 		 598 aa  270  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  32.68 
 
 		 564 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  33.09 
 
 		 600 aa  270  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  32.66 
 
 		 605 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  33.39 
 
 		 627 aa  266  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  33.03 
 
 		 614 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  33.15 
 
 		 611 aa  258  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  30.69 
 
 		 605 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  31.13 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  30.55 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  38.83 
 
 		 664 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  31.57 
 
 		 626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  38.75 
 
 		 664 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  39.12 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  36.95 
 
 		 671 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  36.95 
 
 		 652 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  36.95 
 
 		 652 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  38.61 
 
 		 621 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  43 
 
 		 630 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  37.2 
 
 		 657 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.39 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  40.48 
 
 		 669 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  37.05 
 
 		 656 aa  206  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  39.06 
 
 		 642 aa  205  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  39.06 
 
 		 672 aa  205  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  39.8 
 
 		 619 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  42 
 
 		 633 aa  203  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  37.67 
 
 		 659 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 478 aa  201  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  29.12 
 
 		 508 aa  200  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  27.69 
 
 		 518 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  32.99 
 
 		 680 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  28.29 
 
 		 536 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  27.69 
 
 		 518 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.6 
 
 		 477 aa  196  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  35.96 
 
 		 621 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  29.5 
 
 		 513 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  28.22 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  35.96 
 
 		 638 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  36.42 
 
 		 601 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  36.42 
 
 		 601 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  28.82 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.82 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  27.7 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  38.64 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  28.85 
 
 		 483 aa  190  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  29.46 
 
 		 515 aa  190  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.63 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  27.94 
 
 		 549 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  27.73 
 
 		 513 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  39.5 
 
 		 602 aa  188  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1064 aa  187  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  27.96 
 
 		 551 aa  187  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  36.11 
 
 		 640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  36.72 
 
 		 604 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.02 
 
 		 551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  28.02 
 
 		 551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.2 
 
 		 504 aa  185  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.27 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  35.5 
 
 		 637 aa  184  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  28.08 
 
 		 544 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  37.07 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  37.07 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>