More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3169 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
513 aa  1029    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  60.58 
 
 
498 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  53.67 
 
 
536 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  54.26 
 
 
508 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  49.59 
 
 
521 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  49.38 
 
 
521 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  52.13 
 
 
489 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  47.9 
 
 
551 aa  445  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  48.68 
 
 
521 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  48.79 
 
 
518 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  48.79 
 
 
518 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  49.41 
 
 
506 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  45.49 
 
 
504 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  43.7 
 
 
511 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  31.3 
 
 
546 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  31.64 
 
 
544 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  31.92 
 
 
546 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  31.75 
 
 
554 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  31.75 
 
 
554 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  31.85 
 
 
551 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  31.85 
 
 
551 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  32.79 
 
 
515 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  32.2 
 
 
561 aa  223  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  29.97 
 
 
568 aa  221  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  31.48 
 
 
549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  31.34 
 
 
551 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  33.87 
 
 
556 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  36.61 
 
 
504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  31.39 
 
 
527 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.75 
 
 
568 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  30.5 
 
 
513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  33.87 
 
 
563 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  36.36 
 
 
483 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.14 
 
 
565 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  27.94 
 
 
568 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  34.88 
 
 
497 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  28.48 
 
 
705 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  32.17 
 
 
599 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  33.86 
 
 
499 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  44.71 
 
 
478 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  33.48 
 
 
502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31 
 
 
476 aa  173  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  27.5 
 
 
803 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  32.27 
 
 
589 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  29.84 
 
 
460 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  33.84 
 
 
592 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  33.63 
 
 
572 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  27.75 
 
 
460 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  27.43 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  31.84 
 
 
604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  35.56 
 
 
621 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  32.71 
 
 
566 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  30.1 
 
 
601 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  32.71 
 
 
574 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  30.1 
 
 
601 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  31.93 
 
 
633 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  30.12 
 
 
576 aa  160  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.67 
 
 
606 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  28.54 
 
 
456 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  32.71 
 
 
656 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  30.7 
 
 
466 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  36.07 
 
 
594 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  31.48 
 
 
630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  32.64 
 
 
664 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  33.84 
 
 
606 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  33.13 
 
 
607 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  31.15 
 
 
619 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  30.79 
 
 
666 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  37.62 
 
 
584 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  31.73 
 
 
614 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  32.53 
 
 
598 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  27.19 
 
 
470 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  31.33 
 
 
580 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  34.41 
 
 
569 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  29.61 
 
 
638 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  37.16 
 
 
611 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  36.48 
 
 
637 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  31.33 
 
 
605 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  31.33 
 
 
671 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  31.33 
 
 
652 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  31.33 
 
 
652 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  33.54 
 
 
621 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  35.05 
 
 
594 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  29.79 
 
 
464 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  29.79 
 
 
464 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  31.5 
 
 
669 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  31 
 
 
605 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  28.99 
 
 
605 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  36.9 
 
 
516 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  32.07 
 
 
626 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  28.22 
 
 
561 aa  150  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  27.54 
 
 
463 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  32.05 
 
 
581 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  32.42 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.89 
 
 
664 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  35.76 
 
 
590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  28.69 
 
 
457 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  30.53 
 
 
809 aa  148  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  28.69 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  29.68 
 
 
492 aa  147  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>