More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7879 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 483 aa  979    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  64.61 
 
 		 497 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  59.72 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  52.78 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  49.46 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  37.37 
 
 		 513 aa  337  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  38.57 
 
 		 515 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  58.4 
 
 		 516 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  33.97 
 
 		 521 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  36.88 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  34.65 
 
 		 508 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  35.27 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  32.26 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  32.26 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  33.26 
 
 		 521 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  29.39 
 
 		 599 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  35.99 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  28.54 
 
 		 705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  32.06 
 
 		 489 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  33.14 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  33.04 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  32.01 
 
 		 536 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.39 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.54 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  31.54 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  32.15 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.97 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  29.29 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  28.57 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.57 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  29.36 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.63 
 
 		 546 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  28.27 
 
 		 556 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.9 
 
 		 527 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.7 
 
 		 568 aa  162  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  29.27 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.96 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  28.96 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  28.62 
 
 		 568 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  27.31 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  28.06 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  27.96 
 
 		 563 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  26.77 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  27.16 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  38.01 
 
 		 545 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  30.63 
 
 		 621 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  26.03 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25.64 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  26.4 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  27.61 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  25.7 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  28.52 
 
 		 746 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  31.34 
 
 		 673 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  28.18 
 
 		 871 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  29 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  30.11 
 
 		 605 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  30.09 
 
 		 656 aa  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  29.79 
 
 		 941 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  27.29 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  31.4 
 
 		 604 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  28.72 
 
 		 946 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  27.47 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  28.53 
 
 		 638 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  29.48 
 
 		 606 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  28.48 
 
 		 621 aa  120  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  29.06 
 
 		 633 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  29.94 
 
 		 664 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1064 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  26.88 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  26.88 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  30.31 
 
 		 598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  26.02 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  29.06 
 
 		 630 aa  118  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  31.6 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  28.23 
 
 		 809 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  24.71 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  25.75 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.63 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  28.12 
 
 		 594 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  29.97 
 
 		 640 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  31.1 
 
 		 584 aa  116  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  27.13 
 
 		 466 aa  116  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  28.97 
 
 		 626 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  27.59 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  28.37 
 
 		 604 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  24.65 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  27.59 
 
 		 657 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  24.12 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  31.97 
 
 		 611 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  30.04 
 
 		 605 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  27.59 
 
 		 672 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  24.8 
 
 		 461 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  30.5 
 
 		 637 aa  113  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  24.12 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  27.06 
 
 		 619 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  28.19 
 
 		 566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  26.3 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  29.3 
 
 		 593 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  24.22 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>