More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1132 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  100 
 
 
504 aa  1019    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  51.85 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  50.11 
 
 
502 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  47.83 
 
 
483 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  47.99 
 
 
499 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  45.82 
 
 
516 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  37.99 
 
 
515 aa  326  7e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  36.49 
 
 
513 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  34.79 
 
 
508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  36.83 
 
 
513 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  32.13 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  30.93 
 
 
498 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  31.77 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  32.1 
 
 
489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  32.95 
 
 
521 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  31.36 
 
 
521 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  33.61 
 
 
478 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.11 
 
 
527 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  32.43 
 
 
506 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  31.01 
 
 
551 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.76 
 
 
565 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.24 
 
 
511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  29.05 
 
 
544 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  30.25 
 
 
504 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  30.16 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  29.32 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  29.75 
 
 
477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  30.16 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  27.31 
 
 
705 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  27.35 
 
 
554 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  27.35 
 
 
554 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.42 
 
 
546 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  27.96 
 
 
563 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  28.7 
 
 
568 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.37 
 
 
549 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  30.12 
 
 
576 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.48 
 
 
551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  28.48 
 
 
551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  28.24 
 
 
551 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  28.52 
 
 
556 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  27.79 
 
 
568 aa  160  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  25.36 
 
 
746 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  27.55 
 
 
568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  35.21 
 
 
545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  26.33 
 
 
803 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  26.42 
 
 
561 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  26.99 
 
 
561 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  27.74 
 
 
463 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  27.78 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 
463 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  28.61 
 
 
941 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  28.6 
 
 
464 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  28.6 
 
 
464 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  28.33 
 
 
456 aa  124  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  27.81 
 
 
460 aa  123  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  24.68 
 
 
463 aa  123  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  24.26 
 
 
460 aa  123  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  24.94 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  25.97 
 
 
809 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  27.92 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  27.48 
 
 
946 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  24.83 
 
 
460 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  28.83 
 
 
611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.87 
 
 
476 aa  114  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  29.51 
 
 
584 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  30.13 
 
 
621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  32.31 
 
 
599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1692  multicopper oxidase type 2  42.86 
 
 
221 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  31.06 
 
 
470 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  27 
 
 
590 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  26.33 
 
 
871 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  30.85 
 
 
604 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  27.06 
 
 
490 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  25.95 
 
 
468 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  28.65 
 
 
656 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  26.59 
 
 
593 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  28.69 
 
 
680 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  28.53 
 
 
607 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  28.84 
 
 
619 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  31.82 
 
 
594 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  30.08 
 
 
606 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  29.51 
 
 
605 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  25.67 
 
 
460 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  29.51 
 
 
598 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  28.57 
 
 
604 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  28.15 
 
 
572 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  29.03 
 
 
664 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  28.69 
 
 
592 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05397  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  26.65 
 
 
664 aa  99.8  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.436415  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  28.06 
 
 
605 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  31.62 
 
 
463 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  28.53 
 
 
637 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  29.88 
 
 
673 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  29.27 
 
 
630 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  29.05 
 
 
606 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  28.77 
 
 
601 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  23.91 
 
 
457 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  28.32 
 
 
638 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  26.19 
 
 
434 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>