More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3882 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
499 aa  1013    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  62.8 
 
 
497 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  60.89 
 
 
483 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  50.95 
 
 
502 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  49.05 
 
 
504 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  44.93 
 
 
516 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  35.24 
 
 
513 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  34.46 
 
 
515 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  33.68 
 
 
521 aa  210  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  31.5 
 
 
498 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  33.47 
 
 
521 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  31.57 
 
 
508 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  33.61 
 
 
551 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  31.3 
 
 
521 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  32.9 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  33.85 
 
 
536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  29.73 
 
 
506 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  31.29 
 
 
489 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  30 
 
 
518 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  30 
 
 
518 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.04 
 
 
511 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  28.08 
 
 
556 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  28.82 
 
 
563 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.73 
 
 
549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.09 
 
 
565 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.2 
 
 
554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.2 
 
 
554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.3 
 
 
551 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.3 
 
 
551 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.93 
 
 
544 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  27.25 
 
 
546 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.29 
 
 
546 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  29.91 
 
 
504 aa  162  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.08 
 
 
527 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.92 
 
 
551 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  27.04 
 
 
568 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  26.31 
 
 
568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  25.85 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  25 
 
 
803 aa  146  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  35.53 
 
 
545 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  31.18 
 
 
590 aa  123  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  29.9 
 
 
621 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  31.29 
 
 
584 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  30.03 
 
 
579 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  25.81 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  27.25 
 
 
561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  29.21 
 
 
1064 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  29.62 
 
 
673 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25.88 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  29.68 
 
 
604 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  30.57 
 
 
611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  26.81 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  26.81 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  29.03 
 
 
593 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  26.15 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  26.35 
 
 
463 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  28.09 
 
 
599 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  27.02 
 
 
638 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  25.29 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  25.29 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.05 
 
 
476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  25.62 
 
 
871 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  27.66 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  26.4 
 
 
664 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  29.89 
 
 
746 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  24.89 
 
 
466 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  28.66 
 
 
630 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  25.57 
 
 
656 aa  106  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  26.44 
 
 
672 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  24.07 
 
 
437 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  26.22 
 
 
463 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  26.44 
 
 
642 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  25.17 
 
 
460 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  28.87 
 
 
637 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  30.25 
 
 
594 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  28.57 
 
 
605 aa  104  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  29.3 
 
 
602 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  27.8 
 
 
705 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  26.76 
 
 
601 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  40.74 
 
 
941 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  24.94 
 
 
460 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  29.68 
 
 
594 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  26.14 
 
 
657 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  40.74 
 
 
946 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  29.45 
 
 
640 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  27.84 
 
 
564 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  29.75 
 
 
621 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  29.54 
 
 
605 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  26.47 
 
 
601 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  28.52 
 
 
659 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  39.85 
 
 
809 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  28.28 
 
 
680 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  26.89 
 
 
626 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  28.66 
 
 
604 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  28.97 
 
 
463 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  27.98 
 
 
633 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  24.89 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  28.67 
 
 
569 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  28.11 
 
 
568 aa  97.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  27.73 
 
 
630 aa  97.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>