More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0800 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  67.16 
 
 		 463 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 466 aa  947    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  66.74 
 
 		 463 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  61.57 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  41.35 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  40.9 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  40.26 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  40.75 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  41.92 
 
 		 463 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  43.04 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  43.22 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  43.22 
 
 		 468 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  42.78 
 
 		 460 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  39.96 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  39.96 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  42.25 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  42.03 
 
 		 456 aa  292  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  42.11 
 
 		 460 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  39.33 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  37.14 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  34.69 
 
 		 476 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  35.21 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  35.21 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  32.35 
 
 		 508 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  34.38 
 
 		 434 aa  203  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  34.38 
 
 		 434 aa  203  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  36.01 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  35.11 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  34.62 
 
 		 479 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  33.01 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  32.04 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  33.94 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  34.38 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  30.06 
 
 		 504 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.76 
 
 		 546 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.14 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  30.57 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.22 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.11 
 
 		 551 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.11 
 
 		 551 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  25.45 
 
 		 554 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  25.45 
 
 		 554 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.8 
 
 		 544 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.77 
 
 		 527 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  27.67 
 
 		 490 aa  149  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  27.66 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.8 
 
 		 592 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.74 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.87 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.75 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  29.21 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.7 
 
 		 506 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.37 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  28.8 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  26.07 
 
 		 705 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  27.97 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  28.27 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.49 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  26.73 
 
 		 551 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  31.03 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  31.49 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  31.49 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  33.9 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  24.73 
 
 		 561 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.34 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.16 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  30.57 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  27.92 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.71 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.95 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.22 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.14 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  24.57 
 
 		 513 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.14 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  27.65 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 		 586 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  25.31 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  29.43 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.3 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  23.13 
 
 		 515 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  27.74 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  24.82 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  32.72 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  25.31 
 
 		 624 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79365  multicopper oxidase   23.46 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  26.26 
 
 		 515 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  24.63 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  38.81 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  34.22 
 
 		 640 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  27.31 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28.05 
 
 		 547 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  23.77 
 
 		 568 aa  107  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  32.88 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>