More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3196 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 490 aa  991    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  34.35 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  34.88 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  33.4 
 
 		 460 aa  250  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  34.55 
 
 		 456 aa  249  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  33.13 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  37.14 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  34.48 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  34.15 
 
 		 463 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  32.19 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  32.92 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  32.79 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  32.85 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  34.91 
 
 		 437 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  33.89 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  35.61 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  34.08 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  31.11 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  32.93 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  33.93 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.16 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.16 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.57 
 
 		 527 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  30.11 
 
 		 479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  30.64 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  30.24 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  28.74 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  28.74 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  28.98 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  29.93 
 
 		 498 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.22 
 
 		 544 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  25.94 
 
 		 546 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  24.79 
 
 		 546 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.55 
 
 		 549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  27.66 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  28.03 
 
 		 465 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.57 
 
 		 551 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.57 
 
 		 551 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  25.58 
 
 		 554 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  25.58 
 
 		 554 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  28 
 
 		 535 aa  126  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  26.76 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.1 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.75 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  27.98 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  30.04 
 
 		 478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  27.02 
 
 		 705 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.15 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  27.19 
 
 		 489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.4 
 
 		 592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  27.57 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.06 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  24.95 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  28.06 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.57 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  25.75 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  25.67 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  28.51 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  28.51 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  26.49 
 
 		 515 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.25 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  28.45 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  27.06 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.82 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  27.64 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.82 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  25 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  28.45 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  28.45 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  24.95 
 
 		 514 aa  107  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  28.25 
 
 		 516 aa  106  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  36.26 
 
 		 536 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  29.25 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  29.44 
 
 		 533 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.98 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  33.01 
 
 		 457 aa  100  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  30.56 
 
 		 535 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  24.77 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.63 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.31 
 
 		 516 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  29.44 
 
 		 535 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  23.41 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.52 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.86 
 
 		 569 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.64 
 
 		 565 aa  94.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  27.46 
 
 		 519 aa  94.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  31.55 
 
 		 609 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  35.94 
 
 		 498 aa  93.6  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.91 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  27 
 
 		 519 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  28.81 
 
 		 535 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  28.81 
 
 		 535 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.31 
 
 		 536 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 591 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  27.23 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.31 
 
 		 536 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  40.88 
 
 		 521 aa  91.3  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  31.16 
 
 		 630 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>