More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6581 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 478 aa  920    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  83.3 
 
 		 465 aa  757    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  69.79 
 
 		 498 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  63.92 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  63.5 
 
 		 479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  66.82 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  42.41 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  44.29 
 
 		 466 aa  317  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  38.26 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  35.95 
 
 		 476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  35.68 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  35.68 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  30.65 
 
 		 437 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.49 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  32.79 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  32.87 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  32.14 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  32.63 
 
 		 463 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  31.32 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  31.42 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  36.88 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  33.64 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  33.47 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  33.94 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  34.09 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  31.55 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  34.53 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  36.3 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  31.01 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  31.41 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  31.02 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  30.18 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  35.68 
 
 		 442 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  33.97 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.12 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.12 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  35.46 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.35 
 
 		 527 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.56 
 
 		 546 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.21 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  27.46 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.42 
 
 		 546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31.05 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.98 
 
 		 549 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.67 
 
 		 551 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.67 
 
 		 551 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.93 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.93 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  29.42 
 
 		 498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.46 
 
 		 551 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  30.04 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  32.77 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  29.16 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  25.22 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  28.83 
 
 		 592 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  29.83 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  29.77 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  28.31 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  28.31 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.45 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  27.92 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.8 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  26.21 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.79 
 
 		 536 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.79 
 
 		 536 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 536 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  28.48 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 536 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 536 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.64 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  27.72 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  25.97 
 
 		 551 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.18 
 
 		 591 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  29.01 
 
 		 532 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  25.99 
 
 		 521 aa  106  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  25.81 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  24.82 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  23.68 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.83 
 
 		 535 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  29.7 
 
 		 534 aa  103  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  27.02 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  29.7 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  31.46 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  31.46 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  31.46 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  31.46 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  31.46 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.31 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  26.32 
 
 		 551 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.32 
 
 		 496 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  32.4 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.19 
 
 		 504 aa  100  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  33.33 
 
 		 556 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  25.15 
 
 		 533 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  24.74 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>