124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3312 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 440 aa  864    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  71.17 
 
 		 442 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  69.68 
 
 		 442 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  54.13 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  48.77 
 
 		 446 aa  343  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  52.52 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  48.63 
 
 		 436 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  35 
 
 		 478 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  34.52 
 
 		 498 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  34 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  31.29 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  31.08 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  32.45 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.32 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  29.31 
 
 		 508 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  32.73 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  30.04 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  27.11 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  24.74 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  24.74 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  24.94 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25 
 
 		 463 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  24.95 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  26.51 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  25.88 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  24.95 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  22.17 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  26.34 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  25.11 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  24.51 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  26.41 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  24.81 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  24.54 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  25.4 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  25.4 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  24.37 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  24.22 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.88 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.79 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  23.85 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  27.14 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.79 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  22.96 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  25.05 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.62 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  23.64 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  23.77 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  23.61 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  26.09 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  24.11 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.97 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.06 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.96 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.96 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  24.55 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.02 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  22.16 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  23.98 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  41.77 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.54 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  24.36 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  23.9 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  21.99 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  24.56 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  24.56 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  22.16 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  24.61 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  23.34 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.67 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  25.17 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  24.39 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  24.88 
 
 		 535 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  24.88 
 
 		 535 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  24.09 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  21.64 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  25.83 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  25.3 
 
 		 592 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  26.39 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  26.13 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  25 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  36.71 
 
 		 576 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  26.64 
 
 		 511 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  25.85 
 
 		 470 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  23.36 
 
 		 464 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  24.02 
 
 		 532 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  25.85 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  25.85 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  25.85 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 586 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  25.45 
 
 		 536 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  26.59 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  26.07 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  22.7 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 536 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 536 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  25.45 
 
 		 536 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 536 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  26.07 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  26.07 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>