More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2911 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 466 aa  921    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  51 
 
 		 508 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  44.42 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  45.33 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  41.46 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  42.95 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  42.5 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  44.52 
 
 		 478 aa  324  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  36.08 
 
 		 460 aa  243  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.15 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.15 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  30.8 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  33.97 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  35.29 
 
 		 456 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  30.32 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31.45 
 
 		 476 aa  203  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  30.53 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  31.49 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  31.28 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  30.75 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  30.75 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  32.36 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  29.25 
 
 		 468 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  28.99 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  30.36 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  28.84 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  29.78 
 
 		 470 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  30.36 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.75 
 
 		 527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  29.84 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.79 
 
 		 546 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.46 
 
 		 544 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  29.46 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  27 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  27.92 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.79 
 
 		 549 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  30 
 
 		 425 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  27.31 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  27.31 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.58 
 
 		 551 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.58 
 
 		 551 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  29.83 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.24 
 
 		 551 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  31.94 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.26 
 
 		 592 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  31.59 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  30.35 
 
 		 441 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  28.63 
 
 		 490 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  30.19 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.07 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  27.17 
 
 		 508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 		 489 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  30.4 
 
 		 457 aa  120  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  30.3 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  26.1 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  33.6 
 
 		 515 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  26.05 
 
 		 521 aa  113  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  29.67 
 
 		 630 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  34.42 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  26.74 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  25.11 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  29.51 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  29.07 
 
 		 640 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  34.82 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  26.01 
 
 		 521 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  31.05 
 
 		 358 aa  106  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  26.33 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  31.23 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  27.31 
 
 		 621 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  26.65 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  27.68 
 
 		 605 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  28.33 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  28.14 
 
 		 594 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  27.3 
 
 		 664 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  25.51 
 
 		 638 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.05 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  24.23 
 
 		 521 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.37 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.42 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.24 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  39.17 
 
 		 536 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  28.12 
 
 		 605 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  31.82 
 
 		 535 aa  99.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  29.97 
 
 		 564 aa  99  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  28.68 
 
 		 624 aa  98.2  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  25.27 
 
 		 513 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  28.35 
 
 		 809 aa  97.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  27.94 
 
 		 601 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  27.13 
 
 		 601 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  26.39 
 
 		 612 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  26.2 
 
 		 605 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  29.5 
 
 		 581 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  28.77 
 
 		 631 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  24.54 
 
 		 572 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  30.84 
 
 		 359 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  25.69 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  28.77 
 
 		 631 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>