More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1790 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 364 aa  749    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  64.01 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  61.21 
 
 		 358 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  49.36 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  37.04 
 
 		 505 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  36 
 
 		 640 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  33.11 
 
 		 527 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  38.04 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  31.14 
 
 		 549 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  35.82 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  31.91 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  33.69 
 
 		 630 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  32.2 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  31.12 
 
 		 546 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  33.69 
 
 		 609 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  31.12 
 
 		 551 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  31.12 
 
 		 551 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  31.12 
 
 		 551 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  36.06 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  30.74 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  35.53 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  34.57 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  34.42 
 
 		 359 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.8 
 
 		 478 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.74 
 
 		 554 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  28.74 
 
 		 554 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  32.44 
 
 		 459 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  29.91 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  32.97 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  31.89 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  35 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  35.66 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  35.8 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.46 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  33.58 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31.05 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  34.42 
 
 		 456 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  33.88 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  35.02 
 
 		 460 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  34.3 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  30.56 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  33.33 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2506  multicopper oxidase, type 3  29.14 
 
 		 561 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000431664  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  32.67 
 
 		 455 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  33.88 
 
 		 470 aa  122  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  29.55 
 
 		 498 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  33.47 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  31.91 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  34.45 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  33.47 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  26.96 
 
 		 638 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  31.82 
 
 		 433 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  32.94 
 
 		 471 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  32.23 
 
 		 477 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1064 aa  119  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  31.06 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  31.3 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  30.43 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  29.84 
 
 		 633 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  30.86 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  31.98 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  33.46 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.22 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  43.14 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  30.68 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  30.68 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  28.39 
 
 		 579 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  33.08 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  31.64 
 
 		 460 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  28.62 
 
 		 594 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  28.25 
 
 		 460 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  33.47 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  33.47 
 
 		 467 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  30.53 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  29.97 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  30.53 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  31.82 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  31.82 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  30.83 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  31.82 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  31.95 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  31.98 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  28.18 
 
 		 561 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  31.88 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  29.55 
 
 		 621 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  28.53 
 
 		 431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  29.17 
 
 		 564 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  31.88 
 
 		 463 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  29.21 
 
 		 630 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  32.09 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  27.19 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  29.66 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  29.66 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  25.07 
 
 		 627 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  33.33 
 
 		 570 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  31.86 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  33.47 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>