More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3485 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  82.15 
 
 
470 aa  790    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  85.81 
 
 
470 aa  809    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  70.6 
 
 
432 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  75.35 
 
 
462 aa  680    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  80.39 
 
 
470 aa  779    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  82.91 
 
 
484 aa  784    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  80.82 
 
 
470 aa  768    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
471 aa  971    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  75.32 
 
 
467 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  70.6 
 
 
432 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  70.15 
 
 
460 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  71.86 
 
 
468 aa  710    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  83.44 
 
 
471 aa  826    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  85.16 
 
 
470 aa  795    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  94.4 
 
 
477 aa  876    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  78.4 
 
 
463 aa  753    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  75.12 
 
 
462 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  81.96 
 
 
443 aa  768    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  81.08 
 
 
470 aa  784    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  68.88 
 
 
467 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  65.88 
 
 
467 aa  628  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  68.99 
 
 
455 aa  624  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  68.99 
 
 
455 aa  624  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  66.96 
 
 
464 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  70.97 
 
 
488 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  68.51 
 
 
431 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  69.43 
 
 
431 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  68.97 
 
 
431 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  68.74 
 
 
431 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  68.74 
 
 
431 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  68.97 
 
 
431 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  68.74 
 
 
431 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  66.23 
 
 
473 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  68.74 
 
 
431 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  67.74 
 
 
433 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  66.44 
 
 
433 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  65.75 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  66.44 
 
 
433 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  67.5 
 
 
452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  67.67 
 
 
465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  66.21 
 
 
449 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  65.06 
 
 
431 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  65.3 
 
 
449 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  66.67 
 
 
452 aa  584  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  65.07 
 
 
448 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  68.59 
 
 
397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  63.01 
 
 
460 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  61.17 
 
 
455 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  62.3 
 
 
462 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  62.06 
 
 
459 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  61.32 
 
 
459 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  62 
 
 
446 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  52.83 
 
 
474 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  52.95 
 
 
467 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  47.1 
 
 
459 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  45.07 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  44.16 
 
 
472 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  39.47 
 
 
330 aa  216  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  34.76 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  38.2 
 
 
640 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  36.26 
 
 
505 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  37.26 
 
 
457 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  35.71 
 
 
609 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  34.09 
 
 
630 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  27.39 
 
 
554 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  27.39 
 
 
554 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  28.45 
 
 
551 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.36 
 
 
546 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  35.38 
 
 
360 aa  144  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  36.12 
 
 
359 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.07 
 
 
546 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  32 
 
 
360 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  35.23 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  34.72 
 
 
358 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  36.24 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.75 
 
 
544 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.41 
 
 
549 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.55 
 
 
551 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.55 
 
 
551 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  33.47 
 
 
364 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.77 
 
 
460 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  31.91 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.34 
 
 
478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  32.93 
 
 
464 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  32.93 
 
 
464 aa  116  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  27.94 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.92 
 
 
511 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  29.27 
 
 
375 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  46.72 
 
 
584 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  29.12 
 
 
353 aa  106  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  27.86 
 
 
351 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  30.63 
 
 
463 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  35.9 
 
 
463 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  31.64 
 
 
376 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.94 
 
 
565 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  32.42 
 
 
293 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  39.52 
 
 
592 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  31.15 
 
 
398 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  45.6 
 
 
556 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>