More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2506 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2506  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 
561 aa  1159    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000431664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2129  multicopper oxidase family protein  57.42 
 
 
574 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  31.33 
 
 
368 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  29.85 
 
 
358 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  29.53 
 
 
375 aa  126  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  29.73 
 
 
358 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.01 
 
 
360 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  29.14 
 
 
364 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  29.19 
 
 
381 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  29.04 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  29.51 
 
 
505 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  26.24 
 
 
457 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  28.38 
 
 
317 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  29.17 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  25.8 
 
 
544 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 
527 aa  94.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  25.4 
 
 
546 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  27.22 
 
 
460 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.33 
 
 
554 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  28.33 
 
 
554 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.62 
 
 
546 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.94 
 
 
549 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  24.84 
 
 
551 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  24.84 
 
 
551 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  27.61 
 
 
472 aa  88.2  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  27.46 
 
 
468 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  27.56 
 
 
330 aa  87.8  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.16 
 
 
460 aa  87.8  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.09 
 
 
551 aa  87.4  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  28.1 
 
 
467 aa  87  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  26.04 
 
 
640 aa  84.7  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  26.99 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  27.05 
 
 
609 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  27.43 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  28 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  27.48 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.78 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  27.43 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  25.62 
 
 
630 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  27.01 
 
 
460 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  26.39 
 
 
460 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  25.59 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  25.69 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  25.9 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  26.98 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  26.98 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  27.12 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  24.64 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  27.03 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  26.57 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  26.78 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  24.64 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  24.63 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  42.27 
 
 
437 aa  77  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  25.88 
 
 
457 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25.3 
 
 
463 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  27.37 
 
 
488 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  26.54 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  25.66 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  24.05 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  25.65 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  26.59 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  25.42 
 
 
470 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  26.63 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  24.73 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  36.94 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  26.04 
 
 
579 aa  73.9  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  26.69 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  36.94 
 
 
576 aa  73.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  25.66 
 
 
446 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  41.9 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  25.66 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  27.59 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  26.18 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  24.82 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  25.64 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  26.18 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  25.66 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  25.64 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  24.57 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  24.23 
 
 
463 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  34.21 
 
 
535 aa  72  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  25 
 
 
584 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  26.01 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.68 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  24.35 
 
 
473 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  25.33 
 
 
568 aa  70.5  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  35.51 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  24.1 
 
 
633 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  24.46 
 
 
630 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  25.64 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  25.95 
 
 
664 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  36.73 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  23.62 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  26.77 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  25.66 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>