More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1542 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 472 aa  983    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  42.42 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  42.82 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  42.82 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  41.05 
 
 		 432 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  41.05 
 
 		 432 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  42.82 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  42.86 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  43.37 
 
 		 431 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  43.37 
 
 		 431 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  43.37 
 
 		 431 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  43.37 
 
 		 431 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  41.58 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  45.79 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  39.57 
 
 		 460 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  42.82 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  45.51 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  45.51 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  44.78 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  47.35 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  41.76 
 
 		 433 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  41.76 
 
 		 433 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  41.71 
 
 		 431 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  41.96 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  41.69 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  41.06 
 
 		 455 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  47.02 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  45.55 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  44.22 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  38.46 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  44.44 
 
 		 470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  45.49 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  47.19 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  46.69 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  39.56 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  40.32 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  42.45 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  43.81 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  42.77 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  44.14 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  44.86 
 
 		 484 aa  239  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  45.02 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  44.41 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  45.79 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  45.76 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  44.14 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  44.48 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  46.52 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  44.78 
 
 		 470 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  38.64 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  45.79 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  39.89 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  43.39 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  43.56 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  44.18 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  42.37 
 
 		 317 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  42.86 
 
 		 470 aa  226  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  38.52 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  37.01 
 
 		 330 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  35.08 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  35.44 
 
 		 640 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  38.58 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  34.15 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 630 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  32.99 
 
 		 609 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  32.71 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.76 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  32.84 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  34.43 
 
 		 358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.42 
 
 		 544 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  32.58 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.06 
 
 		 546 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  31.6 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  30.69 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  32.2 
 
 		 358 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  41.56 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  31.28 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  31.28 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  28.92 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  31.29 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  50.48 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  37.79 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  37.79 
 
 		 604 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  31.13 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31.4 
 
 		 476 aa  113  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  42.65 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  32.11 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  42.86 
 
 		 568 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  37.23 
 
 		 568 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  42.65 
 
 		 633 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  34.41 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  42.65 
 
 		 630 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  43.8 
 
 		 584 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  49.52 
 
 		 627 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  37.96 
 
 		 568 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  33.18 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  39.13 
 
 		 551 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  28.23 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  35.05 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  35.05 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>