More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5029 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 449 aa  930    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  70.65 
 
 		 465 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  90.42 
 
 		 449 aa  855    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  91.67 
 
 		 448 aa  843    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  71.96 
 
 		 464 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  73.1 
 
 		 467 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  72.64 
 
 		 467 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  68.91 
 
 		 433 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  70.3 
 
 		 432 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  70.3 
 
 		 432 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  69.68 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  68.75 
 
 		 431 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  69.44 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  68.91 
 
 		 433 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  69.44 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  69.68 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  69.68 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  68.06 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  68.98 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  68.98 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  68.98 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  67.45 
 
 		 460 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  67.59 
 
 		 473 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  66.67 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  71.03 
 
 		 397 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  65.32 
 
 		 467 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  68.32 
 
 		 455 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  65.27 
 
 		 470 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  67.57 
 
 		 459 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  68.35 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  66.67 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  66.67 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  66.21 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  66.27 
 
 		 462 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  64.79 
 
 		 452 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  66.03 
 
 		 459 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  64.96 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  65.67 
 
 		 468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  65.09 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  63.84 
 
 		 471 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  64.06 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  68.7 
 
 		 470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  67.4 
 
 		 477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  65.03 
 
 		 470 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  66.19 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  65.53 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  65.79 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  62.16 
 
 		 446 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  65.05 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  64.77 
 
 		 484 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  64.1 
 
 		 470 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  66.25 
 
 		 488 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  53.63 
 
 		 467 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  54.46 
 
 		 474 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  47.7 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  45.95 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  41.06 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  37.58 
 
 		 330 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  39.47 
 
 		 640 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  35.77 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  33.67 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  37.02 
 
 		 505 aa  170  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  35.96 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 		 630 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.35 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  25.13 
 
 		 544 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  37.73 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  35.34 
 
 		 358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  34.59 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  31.95 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  29.82 
 
 		 554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  29.82 
 
 		 554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  29.29 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  33.2 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  31.3 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.2 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.63 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  34.64 
 
 		 551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  23.17 
 
 		 546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.53 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  33.2 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.44 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  28.44 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  33.06 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.3 
 
 		 546 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  32.28 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  32.88 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  33.96 
 
 		 594 aa  110  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  39.72 
 
 		 659 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  34.1 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  29.92 
 
 		 568 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  40.79 
 
 		 569 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  46.03 
 
 		 556 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  31.22 
 
 		 463 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  31.22 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  46.03 
 
 		 611 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  36.21 
 
 		 568 aa  106  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  42.41 
 
 		 604 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  40.54 
 
 		 598 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  25.76 
 
 		 341 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>