More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4903 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  73.6 
 
 		 432 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  88.39 
 
 		 464 aa  866    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  70.72 
 
 		 452 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  72.97 
 
 		 446 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  72.95 
 
 		 460 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  84.58 
 
 		 467 aa  835    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 465 aa  962    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  73.43 
 
 		 431 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  73.89 
 
 		 431 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  73.43 
 
 		 431 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  72.9 
 
 		 433 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  73.66 
 
 		 433 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  85.87 
 
 		 467 aa  843    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  72.9 
 
 		 433 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  72.03 
 
 		 431 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  74.36 
 
 		 431 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  73.3 
 
 		 459 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  71.82 
 
 		 459 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  74.23 
 
 		 462 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  73.66 
 
 		 431 aa  673    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  73.43 
 
 		 431 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  73.43 
 
 		 431 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  73.6 
 
 		 432 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  70.43 
 
 		 449 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  70.83 
 
 		 473 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  73.66 
 
 		 431 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  73.43 
 
 		 431 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  71.33 
 
 		 452 aa  661    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  70.5 
 
 		 449 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  73.58 
 
 		 455 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  73.63 
 
 		 448 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  74.3 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  66.67 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  65.17 
 
 		 470 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  67.67 
 
 		 471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  61.99 
 
 		 462 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  63.75 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  66.44 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  66.44 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  62.85 
 
 		 460 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  62.2 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  65.17 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  65.68 
 
 		 467 aa  594  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  66.74 
 
 		 470 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  62 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  67.19 
 
 		 443 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  65.99 
 
 		 463 aa  591  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  66.43 
 
 		 477 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  62.42 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  61.06 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  61.7 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  63.68 
 
 		 488 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  52.52 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  51.61 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  46.51 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  44.93 
 
 		 472 aa  229  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  38.74 
 
 		 317 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  34.44 
 
 		 330 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  38.95 
 
 		 640 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  38.06 
 
 		 373 aa  177  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  40 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  33.22 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  35.83 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  35.74 
 
 		 630 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.93 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  28.33 
 
 		 544 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.8 
 
 		 546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.09 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  34.45 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  33.55 
 
 		 358 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.49 
 
 		 549 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  30.72 
 
 		 360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  34.08 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  31.8 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.33 
 
 		 551 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.33 
 
 		 551 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  34.74 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.74 
 
 		 551 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  33.67 
 
 		 460 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  30.4 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  45.83 
 
 		 584 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  30.84 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  30.84 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  33.02 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  27.59 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.33 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  27.27 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  28.45 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  26.9 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  29.34 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  39.75 
 
 		 594 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  32.38 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  41.36 
 
 		 604 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  41.36 
 
 		 640 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  45.97 
 
 		 611 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  33.91 
 
 		 614 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  35.42 
 
 		 556 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  32.82 
 
 		 606 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  32.82 
 
 		 606 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  39.55 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>