More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2009 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  74.81 
 
 
460 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  90.91 
 
 
431 aa  756    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  90.15 
 
 
431 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  80.05 
 
 
432 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  100 
 
 
397 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  91.67 
 
 
431 aa  762    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  90.68 
 
 
431 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  96.73 
 
 
433 aa  798    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  100 
 
 
433 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  88.16 
 
 
431 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  90.68 
 
 
431 aa  758    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  100 
 
 
433 aa  818    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  91.16 
 
 
431 aa  757    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  90.91 
 
 
431 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  90.66 
 
 
431 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  80.05 
 
 
432 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  90.91 
 
 
431 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  74.3 
 
 
465 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  74.05 
 
 
467 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  74.05 
 
 
467 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  73.03 
 
 
446 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  73.54 
 
 
464 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  73.03 
 
 
452 aa  605  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  72.42 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  71.03 
 
 
449 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  72.16 
 
 
459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  70.78 
 
 
448 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  73.78 
 
 
459 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  70.53 
 
 
449 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  72.41 
 
 
462 aa  597  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  72.24 
 
 
455 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  71.9 
 
 
462 aa  594  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  72.08 
 
 
460 aa  591  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  70.35 
 
 
470 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  71.25 
 
 
473 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  71.86 
 
 
467 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  71.25 
 
 
452 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  70.05 
 
 
470 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  71.03 
 
 
455 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  71.03 
 
 
455 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  69.8 
 
 
470 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  69.8 
 
 
470 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  71.68 
 
 
470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  69.54 
 
 
443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  68.59 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  69.67 
 
 
463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  68.09 
 
 
470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  69.04 
 
 
471 aa  567  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  69.19 
 
 
488 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  67.84 
 
 
477 aa  567  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  67.84 
 
 
484 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  67.51 
 
 
468 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  59.95 
 
 
474 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  58.01 
 
 
467 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  54.5 
 
 
459 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  44.26 
 
 
317 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  47.02 
 
 
472 aa  234  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  39.1 
 
 
330 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  39.47 
 
 
640 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  39.33 
 
 
373 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  36.54 
 
 
505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  37.69 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  37.26 
 
 
609 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  35.03 
 
 
630 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  30.66 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  29.33 
 
 
544 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.88 
 
 
546 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.26 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  33.33 
 
 
358 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  33.65 
 
 
358 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.79 
 
 
549 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  35.78 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.63 
 
 
551 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.63 
 
 
551 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  33.21 
 
 
360 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  37.33 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  33.21 
 
 
360 aa  130  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  33.71 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  32.97 
 
 
463 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  35.62 
 
 
460 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  32.97 
 
 
463 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.48 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.37 
 
 
551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  36.36 
 
 
456 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  37.24 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  33.2 
 
 
376 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  31.95 
 
 
584 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.61 
 
 
511 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  33.99 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  33.99 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  31.7 
 
 
364 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  32.51 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  34.09 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  33.99 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  33.88 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  30.92 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
464 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  45.53 
 
 
556 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
464 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  47.32 
 
 
561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>