More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4419 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  100 
 
 		 376 aa  766    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  64.95 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  59.21 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  51.15 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  51.95 
 
 		 312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  52.46 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  58.2 
 
 		 293 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  49.18 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  47.1 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  47.48 
 
 		 338 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  46.4 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  46.93 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  44.96 
 
 		 333 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  46.13 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  44.6 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  40.85 
 
 		 419 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.7 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  36.18 
 
 		 505 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  35.16 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  32.41 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  34.77 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  32.1 
 
 		 952 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  27.96 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  32.94 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  31.29 
 
 		 856 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  31.6 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  31.92 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  31.6 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  28.9 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  30.65 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  32.81 
 
 		 446 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  33.2 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  32.03 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  33.6 
 
 		 431 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 		 360 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  33.09 
 
 		 911 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  31.37 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.64 
 
 		 527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  31.56 
 
 		 912 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  33.33 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  31.37 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  28.52 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  32.94 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  32.94 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  31.91 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  31.01 
 
 		 876 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  31.78 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  30.03 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  31.66 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  31.66 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  32.03 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  31.23 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  32.28 
 
 		 452 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  32.2 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  31.17 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  32.03 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  31.89 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  30.15 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  32.03 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  30.47 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 		 459 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  31.25 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  31.54 
 
 		 857 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  32.02 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  30.71 
 
 		 449 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  30.08 
 
 		 481 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  30.47 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  31.64 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  30.35 
 
 		 878 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  30.04 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  30.47 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  30.71 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  30.62 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.55 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  30.98 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  30.98 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  30.86 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  29.51 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  33.33 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  30.31 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  30.2 
 
 		 470 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  38.1 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  29.76 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  30.19 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  30.58 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  30.2 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  32.65 
 
 		 551 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 		 535 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  32.65 
 
 		 551 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  30.47 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  32.39 
 
 		 640 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  32.65 
 
 		 546 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  33.33 
 
 		 546 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 554 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  32.14 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>