More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1680 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
317 aa  661    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  56.06 
 
 
330 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  44.59 
 
 
431 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  45.57 
 
 
433 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  45.9 
 
 
431 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  44.7 
 
 
455 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  44.7 
 
 
455 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  45.54 
 
 
431 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  45.54 
 
 
431 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  45.07 
 
 
471 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  45.57 
 
 
431 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  43.71 
 
 
459 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  45.57 
 
 
431 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  44.51 
 
 
470 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  45.57 
 
 
431 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  45.07 
 
 
471 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  43.71 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  44.26 
 
 
433 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  44.26 
 
 
433 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  44.26 
 
 
397 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  44.74 
 
 
470 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  44.7 
 
 
431 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  44.59 
 
 
470 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  43.77 
 
 
470 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  44.08 
 
 
470 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  43.93 
 
 
431 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  44.74 
 
 
477 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  43.75 
 
 
463 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  42.63 
 
 
460 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  41.64 
 
 
446 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  43.43 
 
 
459 aa  238  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  43.05 
 
 
462 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  43.05 
 
 
462 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  43.26 
 
 
467 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  43.61 
 
 
431 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  46.1 
 
 
474 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  43.05 
 
 
432 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  43.05 
 
 
432 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  41.72 
 
 
455 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  42.32 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  42.76 
 
 
470 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  42.32 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  45.76 
 
 
467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  43.49 
 
 
488 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  40.5 
 
 
460 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  43.09 
 
 
443 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  43.54 
 
 
452 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  40.73 
 
 
467 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  40.73 
 
 
467 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  43.38 
 
 
527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  41.53 
 
 
452 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  41.06 
 
 
449 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  40.53 
 
 
473 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  42.16 
 
 
472 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  41.12 
 
 
448 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  41.58 
 
 
449 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  40.67 
 
 
640 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  40.82 
 
 
459 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  38.74 
 
 
465 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  38.05 
 
 
457 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  37.75 
 
 
464 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  39.19 
 
 
505 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  36.82 
 
 
609 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  38.65 
 
 
630 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  40.07 
 
 
373 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  35.44 
 
 
551 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  35.44 
 
 
551 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  36.34 
 
 
544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  35.35 
 
 
549 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  36.01 
 
 
546 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  34.34 
 
 
554 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  34.34 
 
 
554 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  37.21 
 
 
546 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  34.31 
 
 
551 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  36.21 
 
 
358 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  35.55 
 
 
358 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  32.2 
 
 
364 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  36.82 
 
 
359 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  31.99 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  36.53 
 
 
478 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  34.75 
 
 
511 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  31.89 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  34.25 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  33.46 
 
 
375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  32.56 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  33.72 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.72 
 
 
565 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.58 
 
 
460 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  37.32 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  32.46 
 
 
460 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  32.6 
 
 
579 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  31.14 
 
 
680 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  32.69 
 
 
605 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  32.68 
 
 
630 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.98 
 
 
598 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  33.78 
 
 
621 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  31.99 
 
 
640 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  31.91 
 
 
607 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  30.83 
 
 
584 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  47.37 
 
 
604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>