More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4026 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  73.35 
 
 		 460 aa  667    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  71.99 
 
 		 467 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  72.56 
 
 		 467 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  80.05 
 
 		 397 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  71.69 
 
 		 470 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  80.74 
 
 		 431 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  80.79 
 
 		 431 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  80.56 
 
 		 433 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  73.58 
 
 		 455 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  77.55 
 
 		 431 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  75.24 
 
 		 459 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  72.81 
 
 		 459 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  73.52 
 
 		 462 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  73.13 
 
 		 464 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  71.93 
 
 		 470 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 432 aa  890    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  72.33 
 
 		 467 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  79.81 
 
 		 431 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  78.19 
 
 		 431 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  80.05 
 
 		 431 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 432 aa  890    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  79.86 
 
 		 433 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  79.81 
 
 		 431 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  80.05 
 
 		 431 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  79.63 
 
 		 431 aa  735    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  79.86 
 
 		 433 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  73.6 
 
 		 465 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  79.81 
 
 		 431 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  71.43 
 
 		 452 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  75.43 
 
 		 443 aa  631  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  70.77 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  70.3 
 
 		 449 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  70 
 
 		 473 aa  624  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  69.89 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  70.26 
 
 		 449 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  68.98 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  70.6 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  70.3 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  70.77 
 
 		 470 aa  614  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  69.84 
 
 		 448 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  69.91 
 
 		 460 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  73.13 
 
 		 446 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  69.53 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  69.53 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  70.87 
 
 		 452 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  71.01 
 
 		 462 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  70.52 
 
 		 462 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  68.69 
 
 		 468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  68.45 
 
 		 477 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  66.67 
 
 		 463 aa  594  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  69.78 
 
 		 484 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  67.74 
 
 		 488 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  56.21 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  54.52 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  50.94 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  48.83 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  43.05 
 
 		 317 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  41.06 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  41.24 
 
 		 640 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  37.69 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  34.03 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  34.69 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  38.02 
 
 		 630 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  34.88 
 
 		 609 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  30.23 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  34.88 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  35.22 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  36.84 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  33.65 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  35.02 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 		 544 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.85 
 
 		 549 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  37.39 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  33.08 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  29.39 
 
 		 478 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.86 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  31.14 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  25.87 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  31.14 
 
 		 463 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.14 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  35 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.14 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.14 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  35 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.45 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.45 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  34.02 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  44.97 
 
 		 640 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  44.97 
 
 		 604 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  30.27 
 
 		 606 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  44.97 
 
 		 626 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  24.56 
 
 		 551 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  48 
 
 		 611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  47.97 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  35.79 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  42.65 
 
 		 600 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  42.28 
 
 		 627 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.62 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  45.45 
 
 		 598 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  30.43 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>