More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4385 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  72.64 
 
 		 467 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  77.93 
 
 		 446 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  71.87 
 
 		 431 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  72.81 
 
 		 432 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  71.46 
 
 		 467 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  72.27 
 
 		 431 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  72.81 
 
 		 432 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  71.39 
 
 		 433 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  80.43 
 
 		 459 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 459 aa  941    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  97.52 
 
 		 462 aa  890    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  69.14 
 
 		 464 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  71.09 
 
 		 431 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  78 
 
 		 460 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  81.76 
 
 		 455 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  71.39 
 
 		 431 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  71.82 
 
 		 465 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  70.69 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  70.85 
 
 		 431 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  70.69 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  70.85 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  70.85 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  71.16 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  70.85 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  70.85 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  70.69 
 
 		 452 aa  611  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  72.16 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  69.03 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  63.62 
 
 		 448 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  66.03 
 
 		 449 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  66.51 
 
 		 449 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  66.21 
 
 		 452 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  63.55 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  65.57 
 
 		 470 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  63.22 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  63.22 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  61.28 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  63.32 
 
 		 470 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  60.59 
 
 		 470 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  62.33 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  63.64 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  61.49 
 
 		 460 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  59.18 
 
 		 470 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  63.16 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  65.12 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  62.68 
 
 		 470 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  61.59 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  63.12 
 
 		 463 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  61.88 
 
 		 468 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  65.31 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  61.59 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  60.42 
 
 		 477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  52.04 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  52.48 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  49.89 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  43.71 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  47.47 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  40.07 
 
 		 330 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  41.26 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  38.98 
 
 		 505 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  36.01 
 
 		 640 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  37.45 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  34.63 
 
 		 630 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  34.19 
 
 		 609 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  31.39 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  34.23 
 
 		 360 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.27 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  33.62 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  33.83 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  32.7 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  32.58 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  35.21 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  24.93 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  29.66 
 
 		 360 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.37 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  33.33 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  29.39 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  29.39 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.64 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  30.7 
 
 		 584 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  33.8 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  32.87 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  29.23 
 
 		 556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  32.22 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  32.58 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  41.67 
 
 		 598 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  30.57 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  33.99 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  33.99 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  33.99 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  42.41 
 
 		 604 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  33.99 
 
 		 551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  31.94 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  39.72 
 
 		 579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  31.94 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  42.41 
 
 		 640 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.79 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  32.41 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  41.14 
 
 		 630 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>