More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1634 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  100 
 
 
484 aa  995    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  79.75 
 
 
471 aa  801    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  69.13 
 
 
462 aa  653    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  71.88 
 
 
468 aa  704    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  78.44 
 
 
470 aa  765    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  81.37 
 
 
470 aa  761    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  78.9 
 
 
470 aa  769    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  82.91 
 
 
471 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  76.16 
 
 
470 aa  739    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  74.89 
 
 
467 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  82.28 
 
 
470 aa  783    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  77.78 
 
 
470 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  79.59 
 
 
443 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  67.41 
 
 
460 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  82.91 
 
 
477 aa  781    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  74.58 
 
 
463 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  70.78 
 
 
462 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  68.51 
 
 
432 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  68.51 
 
 
432 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  68.51 
 
 
431 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  65.83 
 
 
488 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  63.98 
 
 
467 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  68.74 
 
 
431 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  66.23 
 
 
455 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  66.23 
 
 
455 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  67.58 
 
 
473 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  68.74 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  64.19 
 
 
467 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  68.28 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  66.9 
 
 
431 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  68.05 
 
 
431 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  68.05 
 
 
431 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  68.05 
 
 
431 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  68.05 
 
 
431 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  66.44 
 
 
433 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  66.44 
 
 
433 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  66.67 
 
 
433 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  66.21 
 
 
431 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  64.08 
 
 
452 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  65 
 
 
449 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  63.18 
 
 
464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  61.7 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  62.67 
 
 
449 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  68.01 
 
 
397 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  63.76 
 
 
452 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  62.89 
 
 
448 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  60.96 
 
 
460 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  62.85 
 
 
462 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  61.19 
 
 
455 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  61.59 
 
 
459 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  63.55 
 
 
459 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  61.47 
 
 
446 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  53.61 
 
 
474 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  52.89 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  47.79 
 
 
459 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  42.32 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  40.72 
 
 
472 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  38.64 
 
 
330 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  38.43 
 
 
373 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  32.29 
 
 
527 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  37.08 
 
 
640 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  35.5 
 
 
505 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  33.84 
 
 
457 aa  160  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  32.58 
 
 
609 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 
630 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.91 
 
 
551 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.1 
 
 
546 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  28.62 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.9 
 
 
546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  31.69 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  32.44 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  34.87 
 
 
359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  29.21 
 
 
551 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  29.21 
 
 
551 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.43 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  31.97 
 
 
358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  32.45 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  33.62 
 
 
460 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.33 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  29.77 
 
 
554 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  29.77 
 
 
554 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  31.91 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  31.3 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.97 
 
 
478 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  46.46 
 
 
556 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  30.2 
 
 
464 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  30.2 
 
 
464 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  29.89 
 
 
565 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  46.72 
 
 
584 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  42.03 
 
 
569 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  27.87 
 
 
375 aa  104  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  42.5 
 
 
605 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  44.88 
 
 
611 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  27.94 
 
 
381 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  30.86 
 
 
376 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  39.07 
 
 
579 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  36 
 
 
463 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  29.71 
 
 
511 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  30.17 
 
 
398 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  42.54 
 
 
598 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>