More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4388 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 460 aa  923    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  37.53 
 
 		 464 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  37.53 
 
 		 464 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  38.99 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  38.51 
 
 		 456 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  37.58 
 
 		 508 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  36.71 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  36.44 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  39.18 
 
 		 466 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  37.42 
 
 		 463 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  37.2 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  36.03 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  34.35 
 
 		 437 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  39.73 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  36.62 
 
 		 468 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  36.38 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  38.37 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  36.53 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  36.41 
 
 		 463 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  37 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  38.55 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  38.33 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  35.08 
 
 		 460 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  38.2 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  35.1 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  35.96 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  37.94 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  37.33 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  37.33 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  33.63 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  35.87 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  38.16 
 
 		 478 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  31.68 
 
 		 527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  30.68 
 
 		 544 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  30.79 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  29.72 
 
 		 546 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  34.08 
 
 		 490 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  30.74 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  30.45 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  30.45 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  29.55 
 
 		 551 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30.83 
 
 		 565 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  33.71 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  33.68 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  30.62 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  27.96 
 
 		 535 aa  176  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  28.46 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  31.47 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  28.27 
 
 		 521 aa  170  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  30.07 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  29.64 
 
 		 513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  30.23 
 
 		 508 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  27.5 
 
 		 705 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  32.15 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  27.88 
 
 		 513 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  30.24 
 
 		 506 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.36 
 
 		 592 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  28.15 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  32.42 
 
 		 535 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  28.54 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  27.87 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  32.42 
 
 		 535 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  33.41 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 		 586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  31.13 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  31.13 
 
 		 536 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  31.57 
 
 		 569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.57 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  27.98 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  30.08 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  31.59 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  31.54 
 
 		 657 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  25.83 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  31.17 
 
 		 531 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  28.15 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 		 579 aa  146  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.79 
 
 		 496 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  34.21 
 
 		 809 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 591 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.11 
 
 		 522 aa  143  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  36.21 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  36.21 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  36.21 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  29.9 
 
 		 672 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  30.79 
 
 		 642 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  35.78 
 
 		 431 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  35.34 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  36.24 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  35.78 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  29.61 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  35.34 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  34.91 
 
 		 431 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  34.51 
 
 		 601 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  34.51 
 
 		 601 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  35.78 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>