267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2129 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2129  multicopper oxidase family protein  100 
 
 		 574 aa  1196    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2506  multicopper oxidase, type 3  57.42 
 
 		 561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000431664  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 368 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  28.71 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  26.75 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  27.3 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  25.8 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  27.55 
 
 		 358 aa  103  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  29.07 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  28.23 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  25.68 
 
 		 360 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  26.19 
 
 		 457 aa  90.1  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  28.16 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  24.62 
 
 		 544 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  25.59 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  25.59 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  23.27 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  23.27 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  23.74 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  24.14 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.24 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  24.73 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  25 
 
 		 546 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  25.5 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  23.47 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  27.17 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  25.62 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  27.7 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  22.11 
 
 		 630 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  23.53 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  26.13 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  25.78 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  24.91 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  25.93 
 
 		 468 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 331 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  26.17 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  26.17 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  24.91 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  25.74 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  28.03 
 
 		 579 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  25.57 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  36.63 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  23.11 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  24.84 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  26.22 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  23.55 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  26.56 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  26.56 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  26.39 
 
 		 460 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  24.68 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  25 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  25.53 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  32.14 
 
 		 355 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  27.14 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  25.71 
 
 		 431 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  24.35 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  24.82 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  24.53 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  24.91 
 
 		 633 aa  61.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  27.85 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  24.82 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  23.05 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2299  signal peptide protein  20.57 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160622  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  26.42 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  23.83 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  26.84 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  23.43 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  23.43 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  28.17 
 
 		 594 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  24.29 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  25.08 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  35.64 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  25 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  24.91 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  25.86 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  24.29 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  23.1 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  23.1 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  27.31 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  24.37 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  39.6 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  23.08 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  24.64 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  24.37 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  26.15 
 
 		 626 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  24.56 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  25.81 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  24.1 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  24.64 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4702  multicopper oxidase type 3  23.83 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00279928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  24.56 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  36.52 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  24.56 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  27.31 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3162  multicopper oxidase type 3  26.05 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  26.59 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  38.61 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>