179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2299 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2299  signal peptide protein  100 
 
 		 501 aa  1023    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160622  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4702  multicopper oxidase type 3  78.26 
 
 		 504 aa  806    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00279928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  30.5 
 
 		 419 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  32.86 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  38.46 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  33.64 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  35.51 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  33.64 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  32.52 
 
 		 565 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  29.67 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2129  multicopper oxidase family protein  20.55 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.76 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  34.78 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  35.51 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  34.58 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  32.12 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  30.71 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  35.51 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2506  multicopper oxidase, type 3  25.54 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000431664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  32.8 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  36.94 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  21.63 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  32.14 
 
 		 351 aa  57  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  22.84 
 
 		 673 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3162  multicopper oxidase type 3  35.35 
 
 		 371 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  34.43 
 
 		 353 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  29.73 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  32.03 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1610  multicopper oxidase type 3  41.79 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165736  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  35.29 
 
 		 381 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  29.73 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  36.45 
 
 		 368 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  28.95 
 
 		 544 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.95 
 
 		 546 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  28.95 
 
 		 546 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  32.17 
 
 		 460 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  30.56 
 
 		 511 aa  53.5  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  31.01 
 
 		 535 aa  53.5  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  33.64 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  35.45 
 
 		 579 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  26.62 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.95 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  28.95 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  28.95 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  28.95 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  32.61 
 
 		 581 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  32.73 
 
 		 621 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  31.01 
 
 		 592 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  33.33 
 
 		 630 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  26.63 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  31.15 
 
 		 630 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  28.44 
 
 		 680 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  23.43 
 
 		 330 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  35.19 
 
 		 637 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  34.62 
 
 		 626 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  28.76 
 
 		 568 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  30.41 
 
 		 656 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  32.41 
 
 		 659 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  29.05 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  29.37 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  29.37 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06635  Laccase-1 Precursor (EC 1.10.3.2)(Laccase I)(Benzenediol:oxygen oxidoreductase 1)(Urishiol oxidase 1)(Diphenol oxidase 1)(Conidial laccase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17489]  34.58 
 
 		 609 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  32.08 
 
 		 574 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  26.55 
 
 		 457 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.52 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  31.43 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  33.01 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  37.68 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  37.68 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  34.12 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  37.68 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  33.62 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  34.17 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  31.25 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  37.68 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  33.7 
 
 		 504 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  27.73 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.71 
 
 		 664 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  32.08 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  31.78 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  32.71 
 
 		 359 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  34.62 
 
 		 601 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  30.84 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  28.93 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  32.2 
 
 		 584 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  34.62 
 
 		 601 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  30.36 
 
 		 568 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  32.69 
 
 		 452 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  29.41 
 
 		 809 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  26.43 
 
 		 609 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  30.77 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  30.36 
 
 		 568 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  33.65 
 
 		 561 aa  47.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  32.69 
 
 		 594 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>