More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1131 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 351 aa  716    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  79.26 
 
 		 353 aa  595  1e-169  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  57.66 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  52.88 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  49.18 
 
 		 376 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  56.4 
 
 		 293 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  51.28 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  50.92 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  48.56 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  48.16 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  48.23 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  46.62 
 
 		 338 aa  278  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  47.06 
 
 		 341 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  49.08 
 
 		 336 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  40.82 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  39.08 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  35.22 
 
 		 505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  28.67 
 
 		 878 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  29.23 
 
 		 912 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  30.2 
 
 		 857 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  29.8 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  29.84 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  29.86 
 
 		 856 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  30.22 
 
 		 463 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  29.24 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  29.9 
 
 		 471 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  28.75 
 
 		 952 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  28.29 
 
 		 471 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.12 
 
 		 373 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  27.55 
 
 		 876 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  32.81 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  27.84 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  32.42 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  28.63 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  33.2 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  32.42 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  32.81 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 471 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  32.42 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  32.69 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  31.02 
 
 		 431 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  27.41 
 
 		 911 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  30.21 
 
 		 460 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 		 431 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  30.9 
 
 		 449 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  32.81 
 
 		 431 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  32.81 
 
 		 431 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  28.41 
 
 		 526 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  32.42 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  29.93 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  32.82 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  28.71 
 
 		 470 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  28.57 
 
 		 443 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  28.9 
 
 		 463 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  28.81 
 
 		 462 aa  96.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  28.48 
 
 		 462 aa  96.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 		 455 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 		 455 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  29.9 
 
 		 448 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  28.32 
 
 		 446 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  27.18 
 
 		 526 aa  95.9  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  27.57 
 
 		 470 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  29.9 
 
 		 449 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  27.53 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  27.38 
 
 		 479 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  28.38 
 
 		 470 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  27.85 
 
 		 467 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  29.02 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  25 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  32.05 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  32.05 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  26.56 
 
 		 398 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  29.18 
 
 		 460 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  27.81 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  28.92 
 
 		 465 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 		 462 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  24.82 
 
 		 466 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 474 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  27.69 
 
 		 534 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  26.89 
 
 		 464 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  29.51 
 
 		 459 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  27.48 
 
 		 470 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  26.39 
 
 		 452 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  27.56 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  29.28 
 
 		 467 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  25.19 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  25.19 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  28.01 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  25.65 
 
 		 510 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  29.13 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  41.23 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  28.12 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  26.39 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  26.57 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  37.9 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  27.43 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  27.21 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>