More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2648 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  100 
 
 
323 aa  670    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  88.92 
 
 
316 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  61.87 
 
 
307 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  46.45 
 
 
314 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  36.14 
 
 
526 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 
487 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  35.23 
 
 
535 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 
487 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 
535 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 
535 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 
535 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 
487 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  32.18 
 
 
535 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  35.61 
 
 
912 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  36.11 
 
 
534 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  35.61 
 
 
876 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  34.75 
 
 
455 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  36.59 
 
 
878 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  34.86 
 
 
479 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  32.16 
 
 
364 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  33.33 
 
 
463 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  36.79 
 
 
856 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  33.1 
 
 
499 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  33.1 
 
 
499 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  33.92 
 
 
952 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  34.15 
 
 
857 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  32.21 
 
 
510 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  32.87 
 
 
358 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  31.29 
 
 
911 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  31.53 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  33.09 
 
 
471 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.15 
 
 
516 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  28.48 
 
 
466 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  29.73 
 
 
451 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  30.62 
 
 
520 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  30.62 
 
 
520 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  30.62 
 
 
520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  30.62 
 
 
520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  30.62 
 
 
516 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  30.62 
 
 
520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  29.31 
 
 
355 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  30.62 
 
 
520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  30.9 
 
 
362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  31.27 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  32.69 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  30.63 
 
 
481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  28.67 
 
 
486 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  31.2 
 
 
526 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  29.58 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  26.99 
 
 
470 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  30.83 
 
 
969 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  27.67 
 
 
470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  34.38 
 
 
293 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  28.96 
 
 
392 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  26.63 
 
 
444 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  28.52 
 
 
355 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  30.17 
 
 
364 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  29.72 
 
 
367 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  28.72 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  29.21 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  32.58 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  29.62 
 
 
376 aa  92.8  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  30.84 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  26.96 
 
 
366 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  27.85 
 
 
393 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  28.42 
 
 
376 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  26.91 
 
 
369 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  28.37 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  28.46 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  25.68 
 
 
391 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  30.96 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  26.07 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  34.67 
 
 
360 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
419 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.41 
 
 
527 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  26.32 
 
 
358 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  34.4 
 
 
375 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  24.91 
 
 
334 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  28.12 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  26.54 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  29.55 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  25.66 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  28.71 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  27.84 
 
 
565 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  30.23 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  32.32 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  26.28 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.92 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  32.14 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  26.11 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  25.22 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  31.63 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  30.05 
 
 
592 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  31.31 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  27.84 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  31.19 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  26.44 
 
 
612 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  25.94 
 
 
633 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  26.44 
 
 
631 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>