More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0150 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 952 aa  1879    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  45.97 
 
 		 857 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  50.74 
 
 		 911 aa  786    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  45.46 
 
 		 876 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  56.04 
 
 		 912 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  52.2 
 
 		 455 aa  446  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  51.46 
 
 		 526 aa  406  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  48.78 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  42.66 
 
 		 878 aa  330  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  42.47 
 
 		 479 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  37.44 
 
 		 463 aa  246  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  44.7 
 
 		 526 aa  204  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  37.57 
 
 		 969 aa  202  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.64 
 
 		 487 aa  192  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4753  hypothetical protein  43.05 
 
 		 413 aa  191  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  38.56 
 
 		 535 aa  187  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1640  hypothetical protein  38.4 
 
 		 478 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.91 
 
 		 487 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  37.91 
 
 		 535 aa  178  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 487 aa  178  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 535 aa  177  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 535 aa  177  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 535 aa  177  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  36.39 
 
 		 856 aa  168  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  35.23 
 
 		 316 aa  157  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  35.59 
 
 		 534 aa  156  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  33.92 
 
 		 323 aa  152  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  35.69 
 
 		 307 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  34.9 
 
 		 350 aa  141  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  38.11 
 
 		 481 aa  138  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  36.27 
 
 		 358 aa  137  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.32 
 
 		 510 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 444 aa  135  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  56.64 
 
 		 128 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  36.82 
 
 		 499 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  36.82 
 
 		 499 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  31.8 
 
 		 466 aa  131  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  33.09 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  33.09 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  33.09 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  33.09 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  33.09 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  33.09 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  33.09 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  36.92 
 
 		 479 aa  128  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  31.56 
 
 		 355 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  32.1 
 
 		 376 aa  124  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  32.84 
 
 		 355 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  36.18 
 
 		 348 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  32.25 
 
 		 375 aa  118  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  31.88 
 
 		 352 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  30.93 
 
 		 293 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  32.01 
 
 		 362 aa  115  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  29.95 
 
 		 314 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  36.92 
 
 		 451 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  30.66 
 
 		 364 aa  114  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 		 338 aa  114  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  28.62 
 
 		 341 aa  109  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0513  hypothetical protein  33.91 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.205533  normal  0.681284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  33.22 
 
 		 367 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 312 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.28 
 
 		 338 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  29.5 
 
 		 486 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  28.75 
 
 		 351 aa  105  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  27.76 
 
 		 353 aa  102  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  26.12 
 
 		 334 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  27.74 
 
 		 392 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 331 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  26.33 
 
 		 336 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  28.62 
 
 		 391 aa  100  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  28.31 
 
 		 393 aa  96.3  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  27.44 
 
 		 470 aa  95.5  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  27.49 
 
 		 333 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  27.49 
 
 		 333 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  30.86 
 
 		 376 aa  94.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  35.64 
 
 		 419 aa  94  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  30.5 
 
 		 370 aa  93.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  29.77 
 
 		 364 aa  93.2  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  29.97 
 
 		 376 aa  91.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  27.71 
 
 		 470 aa  91.7  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  31.93 
 
 		 374 aa  90.1  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  30.09 
 
 		 369 aa  88.6  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  29.97 
 
 		 376 aa  88.2  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05180  Copper binding protein, plastocyanin/azurin family  48.28 
 
 		 166 aa  87  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  30.04 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  28.61 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  28.23 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  31.3 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  31.3 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  30.51 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.44 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  32.11 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 		 431 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  30.97 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  30.97 
 
 		 455 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  30.74 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  29.36 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  31.13 
 
 		 470 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.99 
 
 		 527 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>