More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3971 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 312 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  81.41 
 
 		 375 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  50.59 
 
 		 419 aa  328  5.0000000000000004e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  54.43 
 
 		 338 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  51.95 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  49.67 
 
 		 355 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  48.14 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  48.16 
 
 		 351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  47.12 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  52.55 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  44 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  44.33 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  46.8 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  43.67 
 
 		 341 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  43.42 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  43.38 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  31.96 
 
 		 444 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  34.1 
 
 		 505 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  31.15 
 
 		 471 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  29.18 
 
 		 856 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  31.45 
 
 		 463 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  32.04 
 
 		 911 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  31.67 
 
 		 878 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  30.77 
 
 		 952 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  41.61 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  30.74 
 
 		 876 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  31.46 
 
 		 455 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  26.16 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.31 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  30.42 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  31.46 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  31.46 
 
 		 462 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  41.18 
 
 		 478 aa  99  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  31.28 
 
 		 398 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  28.83 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.98 
 
 		 527 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  28.62 
 
 		 912 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  29.52 
 
 		 857 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  37.93 
 
 		 549 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  25.45 
 
 		 358 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  28.46 
 
 		 526 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  30.32 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  29.92 
 
 		 474 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  29.09 
 
 		 479 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  29.15 
 
 		 467 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  36.21 
 
 		 551 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  36.21 
 
 		 551 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 526 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  28.88 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  28.79 
 
 		 381 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  35.34 
 
 		 544 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  35.34 
 
 		 546 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  35.34 
 
 		 554 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  35.34 
 
 		 554 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  27.84 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  27.84 
 
 		 432 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  26.37 
 
 		 364 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  31.34 
 
 		 471 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  29.75 
 
 		 470 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  36.21 
 
 		 551 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  27.52 
 
 		 467 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  35.34 
 
 		 546 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  28.47 
 
 		 470 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 		 431 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  28.16 
 
 		 455 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 467 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  26.81 
 
 		 535 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  28.78 
 
 		 431 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 467 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  30.96 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  27.52 
 
 		 455 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  27.52 
 
 		 455 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  32.12 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  29.15 
 
 		 431 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 		 431 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  28 
 
 		 477 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  33.49 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  27.68 
 
 		 431 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  27.2 
 
 		 472 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  28.25 
 
 		 452 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  29.18 
 
 		 443 aa  87  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  27.65 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  27.68 
 
 		 431 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 431 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  27.68 
 
 		 431 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  27.68 
 
 		 431 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  29.06 
 
 		 460 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  26.84 
 
 		 470 aa  86.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  27.94 
 
 		 397 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  27.94 
 
 		 433 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  27.94 
 
 		 433 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  27.78 
 
 		 468 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.09 
 
 		 487 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  29.26 
 
 		 470 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  27.31 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.4 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  27.31 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  28.04 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  26.77 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  28.73 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>