More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1354 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 444 aa  920    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  39.29 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  38.22 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  39.08 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  34.75 
 
 		 341 aa  163  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  36.84 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  36.47 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  33.73 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.72 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  32.7 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  30.19 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  30.19 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  33.99 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  31.96 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  32.53 
 
 		 375 aa  146  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  33.2 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  33.85 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  33.33 
 
 		 952 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  32.49 
 
 		 911 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  32.35 
 
 		 857 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  26.82 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  34.63 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  34.12 
 
 		 878 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  31.27 
 
 		 912 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  31.85 
 
 		 350 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  38.59 
 
 		 876 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  33.73 
 
 		 526 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  35.94 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  33.07 
 
 		 358 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.96 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  32.08 
 
 		 856 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  30.74 
 
 		 373 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  31.07 
 
 		 358 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  28.9 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  29.92 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  33.64 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  30.42 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  28.52 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  31.58 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  31.58 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  31.58 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  33.2 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  27.55 
 
 		 323 aa  99.8  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  27.49 
 
 		 969 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  26.89 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  26.18 
 
 		 534 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  31.73 
 
 		 431 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  30.77 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  31.34 
 
 		 307 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  31.33 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  25.69 
 
 		 510 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  30.88 
 
 		 474 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  28.08 
 
 		 467 aa  97.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 431 aa  96.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  27.7 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  27.7 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  27.7 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.04 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  27.7 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  30.07 
 
 		 316 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  27.7 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  27.7 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  27.7 
 
 		 516 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  27.31 
 
 		 479 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  27.96 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  27.96 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  31.17 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.51 
 
 		 527 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  31.33 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  30.77 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  29.5 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  28.41 
 
 		 535 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  31.35 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  26.01 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  29.48 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  29.89 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  30.77 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  29.48 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.61 
 
 		 478 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  29.89 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  29.87 
 
 		 381 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  36.94 
 
 		 621 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  36.55 
 
 		 592 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  33.51 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  29.86 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  31.89 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  28.09 
 
 		 470 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  29.35 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  36.17 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  38.3 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  28.63 
 
 		 640 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  25.91 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  38.3 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.98 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>