More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1793 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 307 aa  634    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  63.38 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  62.68 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  46.43 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  39.33 
 
 		 535 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40.59 
 
 		 487 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39 
 
 		 487 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.26 
 
 		 487 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 535 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 535 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 535 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 535 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  39.51 
 
 		 526 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  39.42 
 
 		 912 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  38.6 
 
 		 364 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  37.2 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  38.49 
 
 		 857 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  39.53 
 
 		 876 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  36.23 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  36.17 
 
 		 534 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  36.71 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  37.59 
 
 		 878 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  35.29 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  37.06 
 
 		 856 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  35.66 
 
 		 466 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  37.91 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  36.54 
 
 		 911 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  35.74 
 
 		 499 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  32.67 
 
 		 481 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  35.74 
 
 		 499 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.09 
 
 		 510 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  34.64 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  37.4 
 
 		 479 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.61 
 
 		 516 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  33 
 
 		 486 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  34.01 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  34.01 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  34.01 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  34.01 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  34.01 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  34.01 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  34.01 
 
 		 516 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  35.36 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  34.78 
 
 		 479 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  33.12 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  35.82 
 
 		 952 aa  143  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  36.47 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  34.51 
 
 		 526 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  34.97 
 
 		 969 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  32.29 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  28.43 
 
 		 470 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  29.07 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  33 
 
 		 367 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  33.19 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  31.79 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  31.34 
 
 		 444 aa  99  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  33.06 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.01 
 
 		 527 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  30.61 
 
 		 364 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  29.35 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  31.43 
 
 		 391 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  30.56 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  31.15 
 
 		 376 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  27.61 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  31.25 
 
 		 376 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  32.11 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  30.1 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  31.25 
 
 		 376 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  33.49 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  27.09 
 
 		 355 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  27.11 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  29.13 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  28.97 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  28.97 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  30.89 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  32.16 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  31.53 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  30.58 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  27.6 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  35.77 
 
 		 419 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  32.65 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  26.97 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  30.49 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  27.34 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  29.82 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  28.3 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  28.26 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  26.67 
 
 		 633 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  31.84 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  27.15 
 
 		 626 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  26.51 
 
 		 627 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  32.29 
 
 		 657 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  31.19 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  27.42 
 
 		 630 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  32.66 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  32.66 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  30.14 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  34.17 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  31.19 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>