183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1595 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 374 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  65.68 
 
 		 367 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  66.76 
 
 		 370 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  71.34 
 
 		 364 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  68.11 
 
 		 366 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  62.1 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  64.42 
 
 		 369 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  60.67 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  56.87 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  55.95 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  56.45 
 
 		 392 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  63.31 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  60.67 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  56.39 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  33.16 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  37.1 
 
 		 499 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  37.1 
 
 		 499 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  35.28 
 
 		 481 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.87 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.18 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.18 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.18 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.18 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.18 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.18 
 
 		 516 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.18 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  32.88 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 		 516 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  34.73 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  32.95 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.35 
 
 		 479 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  38.77 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  31.66 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  31.99 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  31.08 
 
 		 466 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  32.43 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  31.97 
 
 		 857 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  30.21 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  32.12 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  29.38 
 
 		 912 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  31.73 
 
 		 535 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  31.73 
 
 		 535 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  29.87 
 
 		 455 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 487 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.83 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  32.35 
 
 		 952 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 535 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 535 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 535 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  30.13 
 
 		 314 aa  92.8  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  27.59 
 
 		 856 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  31.65 
 
 		 526 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  29.36 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  27.56 
 
 		 911 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  25.26 
 
 		 470 aa  87  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  27.93 
 
 		 878 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  27.65 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  31.1 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  26.8 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  30.66 
 
 		 876 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  26.62 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  26.56 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  27.22 
 
 		 969 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  27.72 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  30.43 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  28.1 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  27.46 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  31.82 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  31.75 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  33.08 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  29.41 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  36.45 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  35.77 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  31.78 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  29.59 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  31.82 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.82 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  29.37 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  30.19 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  26.82 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  28.86 
 
 		 561 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  27.95 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  28.4 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  28.82 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  29.81 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  28.4 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  32.73 
 
 		 627 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  24.72 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  27.82 
 
 		 505 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  27.69 
 
 		 431 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  32.17 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  30.82 
 
 		 592 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.43 
 
 		 527 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  27.86 
 
 		 633 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>