162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6826 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  100 
 
 		 364 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  79.73 
 
 		 370 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  75.54 
 
 		 369 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  71.15 
 
 		 367 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  72.95 
 
 		 376 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  70.83 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  70.41 
 
 		 366 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  71.17 
 
 		 376 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  70.83 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  69.01 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  65.17 
 
 		 391 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  62.24 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  59.82 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  54.57 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  36.62 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  33.81 
 
 		 534 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  33.94 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  34.26 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.26 
 
 		 520 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.26 
 
 		 520 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.26 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.26 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.26 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.26 
 
 		 516 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.26 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.28 
 
 		 516 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  33.12 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  33.33 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  33.62 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  33.62 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 		 352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  31.99 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  30.95 
 
 		 479 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  35 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  34.42 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  33.2 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  34.29 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 535 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.6 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  35 
 
 		 857 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.27 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  32.35 
 
 		 912 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  29.58 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  29.97 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  30.66 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  30.17 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  30.25 
 
 		 471 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  30.51 
 
 		 307 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  29.77 
 
 		 952 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  28.97 
 
 		 455 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  30.29 
 
 		 911 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  30.03 
 
 		 876 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  30.26 
 
 		 526 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  28.03 
 
 		 878 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  31.07 
 
 		 856 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  28.16 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  29.67 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  28.14 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  30.12 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  25.94 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  30.99 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  28.19 
 
 		 969 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  30.15 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  27.42 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  30.28 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  31.5 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.37 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  32.35 
 
 		 565 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  31.54 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  27.07 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.05 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  29.92 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  25.68 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3364  multicopper oxidase, type 3  31.07 
 
 		 618 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  24.44 
 
 		 581 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.85 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  25.98 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  25.44 
 
 		 630 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  32.71 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  26.04 
 
 		 633 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  29.37 
 
 		 614 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  27.48 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  33.01 
 
 		 128 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  33.72 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  30.08 
 
 		 626 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00878  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  30.7 
 
 		 596 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  26.56 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  29.37 
 
 		 631 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  29.37 
 
 		 631 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  27.41 
 
 		 579 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31.25 
 
 		 656 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  29.37 
 
 		 594 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>