282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1016 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 364 aa  744    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  73.08 
 
 		 362 aa  521  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  52.51 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  53.95 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  44.19 
 
 		 510 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  41.81 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  43.41 
 
 		 499 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  43.41 
 
 		 499 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  43.85 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  42.81 
 
 		 466 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  45.08 
 
 		 516 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  42.77 
 
 		 350 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  44.75 
 
 		 516 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  44.75 
 
 		 520 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  44.75 
 
 		 520 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  44.75 
 
 		 520 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  44.75 
 
 		 520 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  44.75 
 
 		 520 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  44.75 
 
 		 520 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  41.12 
 
 		 479 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  38.69 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  46.26 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  41.36 
 
 		 534 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  38.6 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  31.61 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  33.15 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  36.96 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  31.89 
 
 		 393 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  32.38 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.8 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  28.99 
 
 		 535 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  33.12 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  31.67 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  36.3 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  31.34 
 
 		 463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 		 487 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 487 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 		 535 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  35.2 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  33.88 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  30.9 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  32.33 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  31.82 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  37.78 
 
 		 876 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  33.21 
 
 		 857 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  35.18 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  32.1 
 
 		 479 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  30.94 
 
 		 912 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  30.56 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  31.02 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  31.33 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  30.23 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  34.48 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  32.03 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  32.29 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  30.66 
 
 		 952 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  33.33 
 
 		 878 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  32.97 
 
 		 856 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  29.23 
 
 		 911 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  30.6 
 
 		 969 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  30.28 
 
 		 470 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  26.71 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  31.22 
 
 		 526 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  34.97 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  35.38 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  32.95 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  26.22 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  26.87 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  27.24 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  28.08 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  26.2 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  27.25 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  29.38 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  29.38 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  25.35 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  26.05 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.35 
 
 		 527 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  25.37 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  30.63 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  27.84 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  29.3 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  28.48 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  23.26 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  29.25 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  23.26 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  29.49 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  29.49 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  29.49 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  28.85 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  34.29 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  27.21 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  28.84 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  25.28 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.18 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.84 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  29.49 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>