205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3087 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 352 aa  715    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  53.95 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  59.74 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  56.19 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  44.48 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  43.84 
 
 		 466 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  43.77 
 
 		 516 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  43.09 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  42.76 
 
 		 520 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  42.76 
 
 		 520 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  42.76 
 
 		 520 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  42.76 
 
 		 520 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  42.76 
 
 		 520 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  42.76 
 
 		 516 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  42.76 
 
 		 520 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  40.52 
 
 		 481 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  40.98 
 
 		 510 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  39.14 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  39.27 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  39.27 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  42.05 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  39.06 
 
 		 479 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  41.64 
 
 		 534 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  35.86 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.11 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  35.31 
 
 		 535 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 535 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  33.24 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  32.33 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 487 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  34.2 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  35.57 
 
 		 370 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  34.76 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  34 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  36.36 
 
 		 912 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  34.32 
 
 		 372 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  37.5 
 
 		 876 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  32.95 
 
 		 374 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  36.47 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  32.63 
 
 		 463 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  34.55 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  35.77 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  31.27 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  34.97 
 
 		 857 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  34.81 
 
 		 526 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  35.96 
 
 		 969 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  32.74 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  35.22 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  31.18 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  36.45 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  32.74 
 
 		 911 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  33.45 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  34.8 
 
 		 878 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  33 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  33.71 
 
 		 856 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  32.91 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  32.35 
 
 		 952 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.51 
 
 		 486 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  33.2 
 
 		 526 aa  105  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  28.45 
 
 		 470 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  28.68 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  29.29 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  32.45 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  26.35 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  28.25 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  28.79 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  28.46 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  26.24 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  28.69 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  32.5 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  26.51 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  28.87 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  27.64 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  26.34 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  34.23 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  32.09 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  22.78 
 
 		 527 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  30.89 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  26.47 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.6 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  26.53 
 
 		 609 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  30 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  26.19 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.83 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  24.03 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  24.03 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  32.06 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  27.75 
 
 		 468 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  29.65 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  26.79 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  28.9 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  24.7 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>