171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2243 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 367 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  72.8 
 
 		 370 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  72.68 
 
 		 366 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  70.6 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  68.21 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  72.54 
 
 		 376 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  68.68 
 
 		 369 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  72.24 
 
 		 376 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  73.13 
 
 		 376 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  65.07 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  65.23 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  63.39 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  62.57 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  60.91 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  36.02 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  38.24 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  34.85 
 
 		 534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  35.86 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  36.96 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.78 
 
 		 520 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.78 
 
 		 520 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.78 
 
 		 520 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.78 
 
 		 520 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.78 
 
 		 520 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.78 
 
 		 516 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.78 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  36.66 
 
 		 499 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  36.66 
 
 		 499 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.11 
 
 		 510 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  37.75 
 
 		 348 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.69 
 
 		 516 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  35.71 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  34.59 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  34.42 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.79 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  36.88 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  31.08 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  37.15 
 
 		 857 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  33.88 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  33.45 
 
 		 535 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  33 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  33.45 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.36 
 
 		 487 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  33.22 
 
 		 952 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  32.63 
 
 		 912 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.36 
 
 		 535 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.36 
 
 		 487 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.36 
 
 		 535 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  32.36 
 
 		 535 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  31.66 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  31.38 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  28.49 
 
 		 470 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  29.82 
 
 		 463 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  29.36 
 
 		 455 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  29.72 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  28.16 
 
 		 470 aa  96.3  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  32.69 
 
 		 479 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  30.1 
 
 		 911 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  31.42 
 
 		 876 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  32.1 
 
 		 526 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  33.44 
 
 		 856 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  30.93 
 
 		 878 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.3 
 
 		 486 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  30.68 
 
 		 969 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  31.25 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  25.22 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  28.65 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  34.56 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  31.34 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  34.09 
 
 		 576 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  32.58 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  31.14 
 
 		 581 aa  62.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  32.84 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  28.99 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  33.57 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  40.38 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  38.46 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  26.6 
 
 		 627 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  32.31 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  33.07 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  25.7 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  30.67 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  30.97 
 
 		 621 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  30.2 
 
 		 621 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  27.4 
 
 		 589 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  27.05 
 
 		 614 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  30.94 
 
 		 606 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  26.98 
 
 		 630 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  30.94 
 
 		 607 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  26.17 
 
 		 633 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  27.05 
 
 		 604 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  30.08 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  27.27 
 
 		 594 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  29.49 
 
 		 605 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  32.06 
 
 		 351 aa  53.1  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  26.57 
 
 		 640 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  28.38 
 
 		 579 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  30.41 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>