More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2351 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  49.95 
 
 		 952 aa  809    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  100 
 
 		 912 aa  1776    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  52.51 
 
 		 857 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  58.58 
 
 		 911 aa  894    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  41.01 
 
 		 969 aa  562  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  43.59 
 
 		 878 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  57.33 
 
 		 455 aa  485  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  51.22 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  50.92 
 
 		 526 aa  412  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  63.23 
 
 		 876 aa  376  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  44.78 
 
 		 479 aa  353  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  37.53 
 
 		 463 aa  245  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4753  hypothetical protein  44.84 
 
 		 413 aa  222  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  45.28 
 
 		 526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  39.01 
 
 		 856 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39 
 
 		 487 aa  187  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  35.37 
 
 		 535 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  36.77 
 
 		 350 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  39.42 
 
 		 307 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 		 487 aa  178  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  38.43 
 
 		 534 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  34.76 
 
 		 535 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 		 487 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 		 535 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 		 535 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 		 535 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  35.61 
 
 		 323 aa  169  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  36.33 
 
 		 316 aa  168  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  35.74 
 
 		 358 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  36.19 
 
 		 466 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  36.33 
 
 		 355 aa  162  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  36.09 
 
 		 451 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1640  hypothetical protein  39.02 
 
 		 478 aa  158  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.14 
 
 		 479 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  36.86 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  35.29 
 
 		 348 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  36.68 
 
 		 520 aa  148  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  36.68 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  36.68 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  36.68 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  36.68 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  36.68 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  36.68 
 
 		 516 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.29 
 
 		 516 aa  147  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  36.36 
 
 		 352 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  34.94 
 
 		 510 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  34.57 
 
 		 499 aa  141  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  34.57 
 
 		 499 aa  141  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  56.56 
 
 		 128 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 438 aa  138  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.205533  normal  0.681284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  32.31 
 
 		 362 aa  132  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  30.45 
 
 		 314 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  29.22 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  31.27 
 
 		 444 aa  124  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  31.23 
 
 		 293 aa  121  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  34.23 
 
 		 355 aa  117  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  29.56 
 
 		 486 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  31.54 
 
 		 376 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  31.2 
 
 		 341 aa  113  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  29.23 
 
 		 351 aa  109  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  33.21 
 
 		 376 aa  109  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  31.79 
 
 		 367 aa  107  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  28.79 
 
 		 353 aa  107  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  31.7 
 
 		 376 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  33.21 
 
 		 376 aa  105  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.2 
 
 		 338 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 		 331 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  31.49 
 
 		 370 aa  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  32.35 
 
 		 364 aa  104  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  27.27 
 
 		 392 aa  104  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  27.12 
 
 		 391 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  29.33 
 
 		 375 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  29.08 
 
 		 393 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  31.44 
 
 		 376 aa  101  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  28.33 
 
 		 333 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  28.33 
 
 		 333 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  29.05 
 
 		 336 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  26.8 
 
 		 334 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  29.06 
 
 		 374 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  29.18 
 
 		 312 aa  97.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  32.09 
 
 		 358 aa  94.7  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  29.62 
 
 		 366 aa  94  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  30.98 
 
 		 369 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  27.8 
 
 		 358 aa  93.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  26.8 
 
 		 470 aa  91.3  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  28.29 
 
 		 419 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  28.25 
 
 		 360 aa  89.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  26.8 
 
 		 470 aa  89  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.65 
 
 		 527 aa  87  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  28.97 
 
 		 432 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  28.97 
 
 		 432 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  28.49 
 
 		 368 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  27.41 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05180  Copper binding protein, plastocyanin/azurin family  45.65 
 
 		 166 aa  82.8  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  29.88 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  29.88 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  29.48 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  29.2 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  29.2 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>