More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0503 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 
479 aa  957    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  46.58 
 
 
857 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  47.07 
 
 
471 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  45.52 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  46.88 
 
 
878 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  44.12 
 
 
911 aa  356  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  44.78 
 
 
912 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  48.43 
 
 
856 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  46.36 
 
 
876 aa  329  7e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  43.49 
 
 
952 aa  312  9e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  42.15 
 
 
969 aa  293  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  39.77 
 
 
526 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  34.73 
 
 
463 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  43.56 
 
 
526 aa  216  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  31.33 
 
 
466 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  36.63 
 
 
534 aa  170  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  35.51 
 
 
355 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.79 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.96 
 
 
520 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.96 
 
 
520 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.56 
 
 
487 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.96 
 
 
516 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.96 
 
 
520 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 
516 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.96 
 
 
520 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.96 
 
 
520 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.96 
 
 
520 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  39.08 
 
 
350 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  35.05 
 
 
481 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 
535 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  37.4 
 
 
316 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.44 
 
 
510 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  30.49 
 
 
451 aa  156  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  35.1 
 
 
499 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  35.1 
 
 
499 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 
358 aa  156  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  37.4 
 
 
307 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  35.55 
 
 
323 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
535 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
535 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
535 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
535 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
487 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  33.14 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  34.35 
 
 
352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  34.98 
 
 
362 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  31.27 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  34.87 
 
 
355 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  35.94 
 
 
444 aa  123  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  30.59 
 
 
314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  31.02 
 
 
341 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  28.11 
 
 
336 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.43 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  49.55 
 
 
128 aa  117  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  30.54 
 
 
333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  30.13 
 
 
333 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 
331 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  30.15 
 
 
376 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 
338 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  28.9 
 
 
353 aa  104  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  27.09 
 
 
334 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  26.96 
 
 
486 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  30.22 
 
 
375 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  32.15 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  27.38 
 
 
351 aa  95.9  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  29.09 
 
 
312 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.84 
 
 
527 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  24.65 
 
 
505 aa  90.5  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  29.89 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  30.68 
 
 
376 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  31.99 
 
 
366 aa  87.8  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  26.95 
 
 
393 aa  87.4  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  27.81 
 
 
392 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  31.84 
 
 
640 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  30.94 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  29.52 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  26.1 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  29.7 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  35.76 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.64 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  28.12 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  29.01 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  26.44 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  43.1 
 
 
576 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  32.46 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  30.57 
 
 
376 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  28.5 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05180  Copper binding protein, plastocyanin/azurin family  39.84 
 
 
166 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566763  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  26.46 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  29.81 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  26.71 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  28.14 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  30.71 
 
 
374 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.2 
 
 
592 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  26.43 
 
 
369 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>