More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4008 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
419 aa  868    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  51.54 
 
 
375 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  50.59 
 
 
312 aa  328  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  43.25 
 
 
338 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  42.74 
 
 
355 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  45.31 
 
 
293 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  45.19 
 
 
376 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  40.52 
 
 
353 aa  229  9e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  40.82 
 
 
351 aa  229  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 
331 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  36.18 
 
 
341 aa  192  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  36.36 
 
 
333 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  36.07 
 
 
333 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  34 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  33.5 
 
 
338 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  32.37 
 
 
334 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  28.9 
 
 
444 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  41.98 
 
 
360 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  35.68 
 
 
505 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  35.64 
 
 
952 aa  94  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  27.48 
 
 
358 aa  93.2  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  27.76 
 
 
364 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  37.1 
 
 
471 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  36.36 
 
 
511 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  26.82 
 
 
358 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.85 
 
 
527 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  29.44 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  32.58 
 
 
473 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  28.29 
 
 
912 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  27.66 
 
 
640 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  31.28 
 
 
878 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  26.1 
 
 
471 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  40 
 
 
452 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  38.24 
 
 
455 aa  86.7  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  38.24 
 
 
455 aa  86.7  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  35.9 
 
 
526 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  35.04 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  26.78 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  34.31 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  36.09 
 
 
911 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  26.26 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  38.6 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  38.66 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  38.81 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  38.06 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  32.73 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  38.06 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  32.26 
 
 
856 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  26.1 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  26.6 
 
 
443 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  35.82 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  35.77 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.78 
 
 
598 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  26.69 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  25.59 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  34.06 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  25.58 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  25.91 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  35.56 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  37.82 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  33.56 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  26.91 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  38.06 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  30.56 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  28.24 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  31.82 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  36.36 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  25.64 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  36.8 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  34.64 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  36.97 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  26.25 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  27.14 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  37.31 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  40.78 
 
 
470 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  37.31 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  26.87 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  26.53 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  38.52 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  26.53 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  38.52 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  26.53 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  26.53 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  36.57 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  36.57 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  37.7 
 
 
467 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  35.77 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  36.57 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  26.53 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  35.43 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  25 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  34.92 
 
 
592 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  41.18 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  34.36 
 
 
633 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  33.87 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  38.06 
 
 
626 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  33.87 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  28.08 
 
 
551 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.42 
 
 
546 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>