171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3727 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 369 aa  760    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  80.81 
 
 		 370 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  79.53 
 
 		 364 aa  577  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  68.68 
 
 		 367 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  70.75 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  71.08 
 
 		 376 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  69.69 
 
 		 366 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  70.75 
 
 		 376 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  70.96 
 
 		 376 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  64.86 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  64.35 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  66.95 
 
 		 374 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  62.54 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  60.12 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  34.2 
 
 		 534 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  34.08 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  35.28 
 
 		 499 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  35.28 
 
 		 499 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  36.42 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  34.44 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  36.42 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  36.42 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  36.42 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  36.42 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  36.42 
 
 		 516 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  36.42 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.28 
 
 		 516 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  33.05 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  34.04 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  33.23 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  36.3 
 
 		 348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  35.18 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  33.99 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  32.97 
 
 		 466 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  33 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  32.55 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  34.4 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  31.72 
 
 		 535 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  30.86 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.34 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 487 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  30.27 
 
 		 857 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 535 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 487 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 535 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 535 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  30 
 
 		 912 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  28 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  29.1 
 
 		 471 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  27.27 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  29.78 
 
 		 952 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  28.36 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  27.9 
 
 		 470 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  31.3 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  27.37 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  29.64 
 
 		 911 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  26.65 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  27.7 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  27.18 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  27.74 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  28.98 
 
 		 969 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  27.57 
 
 		 856 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  27.76 
 
 		 876 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  26.64 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  30.05 
 
 		 526 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  26.85 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  29.58 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  34.81 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  32.39 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  31.25 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  31.43 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  27.81 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  32.56 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  31.06 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  36.63 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  24.5 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.32 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  30.77 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  28.03 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  29.81 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  29.45 
 
 		 605 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  28.91 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  30.87 
 
 		 614 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  29.01 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  27.74 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  27.21 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  30.2 
 
 		 592 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  29.22 
 
 		 589 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3364  multicopper oxidase, type 3  28.49 
 
 		 618 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  25.09 
 
 		 572 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00878  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  30.14 
 
 		 596 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  25.5 
 
 		 633 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  28.65 
 
 		 561 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  27.81 
 
 		 612 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  24.26 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  24.74 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  31.78 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  30.16 
 
 		 630 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>