More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2149 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 534 aa  1093    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  57.97 
 
 		 348 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  58.28 
 
 		 479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  51.63 
 
 		 466 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  57.04 
 
 		 516 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  56.7 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  56.7 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  56.7 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  56.7 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  56.7 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  56.7 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  56.7 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  56.9 
 
 		 510 aa  324  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  56.9 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  56.9 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  52.07 
 
 		 451 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  49.85 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  49.48 
 
 		 350 aa  303  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  51.53 
 
 		 358 aa  289  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  44.85 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  41.77 
 
 		 364 aa  239  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  40.82 
 
 		 362 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  41.64 
 
 		 352 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  43.08 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.35 
 
 		 487 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  40.07 
 
 		 857 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  37.63 
 
 		 535 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  37.65 
 
 		 526 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  40.68 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  38.43 
 
 		 912 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  34.41 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.56 
 
 		 487 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  34.59 
 
 		 376 aa  170  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  37.5 
 
 		 911 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  36.2 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 487 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  38.11 
 
 		 479 aa  169  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  36.11 
 
 		 323 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  34.85 
 
 		 367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  39.1 
 
 		 876 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  36.17 
 
 		 307 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  32.74 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  32.34 
 
 		 391 aa  163  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  34.23 
 
 		 376 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  35.92 
 
 		 316 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  37.83 
 
 		 878 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  34.88 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  32.94 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  35.06 
 
 		 952 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  33.63 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  35.46 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  33.72 
 
 		 372 aa  154  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  33.14 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  34.2 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  33.71 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  34.38 
 
 		 856 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  31.82 
 
 		 314 aa  144  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  37.05 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  31.93 
 
 		 374 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  41.72 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  32.23 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  33.57 
 
 		 969 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  30.04 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  24.4 
 
 		 527 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  26.39 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 		 331 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  25.91 
 
 		 341 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  28.74 
 
 		 336 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  25 
 
 		 338 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  29.67 
 
 		 446 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  27.48 
 
 		 351 aa  90.1  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  27.17 
 
 		 353 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  25.1 
 
 		 333 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.51 
 
 		 544 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  28.23 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  25.1 
 
 		 333 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  28.93 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  29.84 
 
 		 376 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.95 
 
 		 457 aa  86.7  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.76 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  29.92 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  28.86 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.76 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  30.36 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  27.87 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  28.16 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  27.61 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  28.81 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  29.96 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  29.96 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  29.96 
 
 		 431 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  28.69 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  28.69 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  28.69 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>